Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWP2

FAM46C, Putative nucleotidyltransferase FAM46C, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM46CQ5VWP2 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM46CQ5VWP2 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms