Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT2

C9orf135, Protein C9orf135, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135Q5VTT2 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC14.27□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC14.26□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
C9orf135Q5VTT2 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms