Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT06

CEP350, Centrosome-associated protein 350, humanhuman

Predictions only

Length 3,117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP350Q5VT06 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CEP350Q5VT06 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CEP350Q5VT06 COX8A-201ENST00000314133 507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CEP350Q5VT06 PLAC9P1-201ENST00000397540 389 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CEP350Q5VT06 TP53I3-203ENST00000407482 747 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CEP350Q5VT06 AC092265.1-201ENST00000422638 498 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CEP350Q5VT06 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CEP350Q5VT06 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CEP350Q5VT06 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CEP350Q5VT06 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CEP350Q5VT06 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CEP350Q5VT06 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CEP350Q5VT06 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CEP350Q5VT06 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CEP350Q5VT06 SPATS1-202ENST00000323108 1107 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CEP350Q5VT06 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CEP350Q5VT06 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CEP350Q5VT06 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CEP350Q5VT06 AQP7P5-201ENST00000428759 1049 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CEP350Q5VT06 AQP7P4-201ENST00000447083 1042 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CEP350Q5VT06 AQP7P2-201ENST00000453967 1041 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CEP350Q5VT06 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CEP350Q5VT06 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CEP350Q5VT06 AQP7P3-201ENST00000624547 1041 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CEP350Q5VT06 LINC00431-202ENST00000636375 159 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CEP350Q5VT06 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CEP350Q5VT06 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CEP350Q5VT06 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CEP350Q5VT06 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CEP350Q5VT06 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CEP350Q5VT06 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CEP350Q5VT06 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CEP350Q5VT06 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CEP350Q5VT06 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CEP350Q5VT06 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CEP350Q5VT06 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CEP350Q5VT06 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CEP350Q5VT06 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CEP350Q5VT06 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CEP350Q5VT06 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CEP350Q5VT06 LINC01868-201ENST00000414965 562 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CEP350Q5VT06 TIMM17B-204ENST00000465150 964 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CEP350Q5VT06 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CEP350Q5VT06 DMKN-256ENST00000492341 738 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CEP350Q5VT06 SNCB-203ENST00000506696 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CEP350Q5VT06 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CEP350Q5VT06 PRB3-202ENST00000538488 1283 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CEP350Q5VT06 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CEP350Q5VT06 PEBP1P2-201ENST00000603980 558 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CEP350Q5VT06 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CEP350Q5VT06 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CEP350Q5VT06 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CEP350Q5VT06 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CEP350Q5VT06 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CEP350Q5VT06 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CEP350Q5VT06 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CEP350Q5VT06 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CEP350Q5VT06 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CEP350Q5VT06 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CEP350Q5VT06 RPL14-203ENST00000416518 812 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CEP350Q5VT06 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CEP350Q5VT06 LINC00466-203ENST00000436475 1059 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CEP350Q5VT06 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CEP350Q5VT06 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CEP350Q5VT06 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CEP350Q5VT06 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CEP350Q5VT06 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CEP350Q5VT06 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CEP350Q5VT06 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CEP350Q5VT06 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CEP350Q5VT06 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CEP350Q5VT06 LINC02228-201ENST00000507600 534 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CEP350Q5VT06 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CEP350Q5VT06 RBM4-211ENST00000530235 1011 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CEP350Q5VT06 AC079949.1-201ENST00000541419 505 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CEP350Q5VT06 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CEP350Q5VT06 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CEP350Q5VT06 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CEP350Q5VT06 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CEP350Q5VT06 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CEP350Q5VT06 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CEP350Q5VT06 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CEP350Q5VT06 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CEP350Q5VT06 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CEP350Q5VT06 NHP2-202ENST00000314397 599 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CEP350Q5VT06 NUDT2-201ENST00000346365 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CEP350Q5VT06 NUDT2-202ENST00000379155 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CEP350Q5VT06 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CEP350Q5VT06 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CEP350Q5VT06 AC142086.5-202ENST00000562500 217 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CEP350Q5VT06 NUDT2-204ENST00000618590 825 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CEP350Q5VT06 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CEP350Q5VT06 AC114812.1-201ENST00000421868 689 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CEP350Q5VT06 LYPLA2P1-203ENST00000447689 696 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CEP350Q5VT06 KHDRBS3-206ENST00000520981 1243 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CEP350Q5VT06 RBFOX3-206ENST00000582043 1143 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CEP350Q5VT06 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CEP350Q5VT06 AC090510.3-201ENST00000615831 821 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CEP350Q5VT06 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CEP350Q5VT06 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms