Protein–RNA interactions for Protein: Q587I9

SFT2D3, Vesicle transport protein SFT2C, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D3Q587I9 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SFT2D3Q587I9 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SFT2D3Q587I9 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SFT2D3Q587I9 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SFT2D3Q587I9 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SFT2D3Q587I9 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SFT2D3Q587I9 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SFT2D3Q587I9 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SFT2D3Q587I9 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SFT2D3Q587I9 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SFT2D3Q587I9 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SFT2D3Q587I9 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SFT2D3Q587I9 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SFT2D3Q587I9 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SFT2D3Q587I9 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SFT2D3Q587I9 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SFT2D3Q587I9 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SFT2D3Q587I9 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SFT2D3Q587I9 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SFT2D3Q587I9 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
SFT2D3Q587I9 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SFT2D3Q587I9 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SFT2D3Q587I9 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SFT2D3Q587I9 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SFT2D3Q587I9 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SFT2D3Q587I9 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
SFT2D3Q587I9 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SFT2D3Q587I9 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SFT2D3Q587I9 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SFT2D3Q587I9 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SFT2D3Q587I9 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SFT2D3Q587I9 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SFT2D3Q587I9 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SFT2D3Q587I9 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SFT2D3Q587I9 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SFT2D3Q587I9 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SFT2D3Q587I9 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SFT2D3Q587I9 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SFT2D3Q587I9 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SFT2D3Q587I9 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SFT2D3Q587I9 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SFT2D3Q587I9 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SFT2D3Q587I9 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SFT2D3Q587I9 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SFT2D3Q587I9 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SFT2D3Q587I9 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SFT2D3Q587I9 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SFT2D3Q587I9 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SFT2D3Q587I9 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SFT2D3Q587I9 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SFT2D3Q587I9 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SFT2D3Q587I9 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SFT2D3Q587I9 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SFT2D3Q587I9 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SFT2D3Q587I9 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SFT2D3Q587I9 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SFT2D3Q587I9 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SFT2D3Q587I9 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SFT2D3Q587I9 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SFT2D3Q587I9 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SFT2D3Q587I9 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SFT2D3Q587I9 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SFT2D3Q587I9 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SFT2D3Q587I9 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SFT2D3Q587I9 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SFT2D3Q587I9 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SFT2D3Q587I9 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SFT2D3Q587I9 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SFT2D3Q587I9 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SFT2D3Q587I9 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SFT2D3Q587I9 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SFT2D3Q587I9 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SFT2D3Q587I9 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SFT2D3Q587I9 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SFT2D3Q587I9 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SFT2D3Q587I9 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SFT2D3Q587I9 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SFT2D3Q587I9 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SFT2D3Q587I9 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SFT2D3Q587I9 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SFT2D3Q587I9 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SFT2D3Q587I9 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SFT2D3Q587I9 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SFT2D3Q587I9 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SFT2D3Q587I9 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SFT2D3Q587I9 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SFT2D3Q587I9 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SFT2D3Q587I9 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SFT2D3Q587I9 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SFT2D3Q587I9 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SFT2D3Q587I9 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SFT2D3Q587I9 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SFT2D3Q587I9 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SFT2D3Q587I9 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SFT2D3Q587I9 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SFT2D3Q587I9 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SFT2D3Q587I9 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SFT2D3Q587I9 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SFT2D3Q587I9 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SFT2D3Q587I9 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms