Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZG55

GREB1, Protein GREB1, humanhuman

Predictions only

Length 1,949 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GREB1Q4ZG55 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GREB1Q4ZG55 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GREB1Q4ZG55 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GREB1Q4ZG55 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GREB1Q4ZG55 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GREB1Q4ZG55 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GREB1Q4ZG55 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GREB1Q4ZG55 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GREB1Q4ZG55 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GREB1Q4ZG55 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GREB1Q4ZG55 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GREB1Q4ZG55 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GREB1Q4ZG55 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GREB1Q4ZG55 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GREB1Q4ZG55 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GREB1Q4ZG55 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GREB1Q4ZG55 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GREB1Q4ZG55 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GREB1Q4ZG55 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GREB1Q4ZG55 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GREB1Q4ZG55 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GREB1Q4ZG55 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GREB1Q4ZG55 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GREB1Q4ZG55 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GREB1Q4ZG55 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GREB1Q4ZG55 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GREB1Q4ZG55 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GREB1Q4ZG55 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GREB1Q4ZG55 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GREB1Q4ZG55 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GREB1Q4ZG55 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GREB1Q4ZG55 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GREB1Q4ZG55 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GREB1Q4ZG55 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GREB1Q4ZG55 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GREB1Q4ZG55 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GREB1Q4ZG55 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GREB1Q4ZG55 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GREB1Q4ZG55 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GREB1Q4ZG55 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GREB1Q4ZG55 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GREB1Q4ZG55 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GREB1Q4ZG55 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GREB1Q4ZG55 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GREB1Q4ZG55 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GREB1Q4ZG55 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GREB1Q4ZG55 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GREB1Q4ZG55 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GREB1Q4ZG55 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GREB1Q4ZG55 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GREB1Q4ZG55 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GREB1Q4ZG55 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GREB1Q4ZG55 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GREB1Q4ZG55 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GREB1Q4ZG55 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GREB1Q4ZG55 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GREB1Q4ZG55 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GREB1Q4ZG55 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GREB1Q4ZG55 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GREB1Q4ZG55 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GREB1Q4ZG55 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GREB1Q4ZG55 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GREB1Q4ZG55 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GREB1Q4ZG55 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GREB1Q4ZG55 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GREB1Q4ZG55 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GREB1Q4ZG55 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GREB1Q4ZG55 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GREB1Q4ZG55 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GREB1Q4ZG55 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GREB1Q4ZG55 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GREB1Q4ZG55 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GREB1Q4ZG55 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GREB1Q4ZG55 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GREB1Q4ZG55 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GREB1Q4ZG55 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GREB1Q4ZG55 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GREB1Q4ZG55 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GREB1Q4ZG55 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GREB1Q4ZG55 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GREB1Q4ZG55 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GREB1Q4ZG55 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GREB1Q4ZG55 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GREB1Q4ZG55 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GREB1Q4ZG55 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GREB1Q4ZG55 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GREB1Q4ZG55 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GREB1Q4ZG55 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GREB1Q4ZG55 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GREB1Q4ZG55 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GREB1Q4ZG55 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GREB1Q4ZG55 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GREB1Q4ZG55 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GREB1Q4ZG55 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GREB1Q4ZG55 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GREB1Q4ZG55 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GREB1Q4ZG55 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GREB1Q4ZG55 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GREB1Q4ZG55 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GREB1Q4ZG55 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms