Protein–RNA interactions for Protein: Q4VX76

SYTL3, Synaptotagmin-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYTL3Q4VX76 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SYTL3Q4VX76 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SYTL3Q4VX76 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SYTL3Q4VX76 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SYTL3Q4VX76 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SYTL3Q4VX76 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SYTL3Q4VX76 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SYTL3Q4VX76 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SYTL3Q4VX76 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SYTL3Q4VX76 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SYTL3Q4VX76 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SYTL3Q4VX76 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SYTL3Q4VX76 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SYTL3Q4VX76 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SYTL3Q4VX76 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SYTL3Q4VX76 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SYTL3Q4VX76 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SYTL3Q4VX76 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SYTL3Q4VX76 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SYTL3Q4VX76 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SYTL3Q4VX76 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SYTL3Q4VX76 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SYTL3Q4VX76 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SYTL3Q4VX76 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SYTL3Q4VX76 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SYTL3Q4VX76 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SYTL3Q4VX76 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SYTL3Q4VX76 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SYTL3Q4VX76 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SYTL3Q4VX76 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SYTL3Q4VX76 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SYTL3Q4VX76 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SYTL3Q4VX76 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SYTL3Q4VX76 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SYTL3Q4VX76 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SYTL3Q4VX76 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SYTL3Q4VX76 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SYTL3Q4VX76 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SYTL3Q4VX76 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SYTL3Q4VX76 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SYTL3Q4VX76 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SYTL3Q4VX76 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SYTL3Q4VX76 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SYTL3Q4VX76 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SYTL3Q4VX76 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SYTL3Q4VX76 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SYTL3Q4VX76 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SYTL3Q4VX76 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SYTL3Q4VX76 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SYTL3Q4VX76 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SYTL3Q4VX76 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SYTL3Q4VX76 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SYTL3Q4VX76 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SYTL3Q4VX76 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SYTL3Q4VX76 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SYTL3Q4VX76 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SYTL3Q4VX76 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SYTL3Q4VX76 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SYTL3Q4VX76 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SYTL3Q4VX76 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SYTL3Q4VX76 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SYTL3Q4VX76 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SYTL3Q4VX76 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SYTL3Q4VX76 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SYTL3Q4VX76 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SYTL3Q4VX76 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SYTL3Q4VX76 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SYTL3Q4VX76 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SYTL3Q4VX76 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SYTL3Q4VX76 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SYTL3Q4VX76 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SYTL3Q4VX76 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SYTL3Q4VX76 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SYTL3Q4VX76 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SYTL3Q4VX76 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SYTL3Q4VX76 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SYTL3Q4VX76 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SYTL3Q4VX76 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SYTL3Q4VX76 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SYTL3Q4VX76 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SYTL3Q4VX76 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SYTL3Q4VX76 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SYTL3Q4VX76 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SYTL3Q4VX76 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SYTL3Q4VX76 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SYTL3Q4VX76 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SYTL3Q4VX76 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SYTL3Q4VX76 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SYTL3Q4VX76 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SYTL3Q4VX76 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SYTL3Q4VX76 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SYTL3Q4VX76 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SYTL3Q4VX76 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SYTL3Q4VX76 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SYTL3Q4VX76 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SYTL3Q4VX76 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SYTL3Q4VX76 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SYTL3Q4VX76 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SYTL3Q4VX76 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SYTL3Q4VX76 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms