Protein–RNA interactions for Protein: Q494R4

CCDC153, Coiled-coil domain-containing protein 153, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC153Q494R4 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC153Q494R4 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC153Q494R4 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC153Q494R4 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC153Q494R4 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC153Q494R4 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC153Q494R4 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC153Q494R4 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC153Q494R4 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC153Q494R4 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC153Q494R4 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC153Q494R4 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC153Q494R4 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC153Q494R4 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC153Q494R4 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC153Q494R4 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC153Q494R4 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC153Q494R4 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC153Q494R4 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC153Q494R4 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC153Q494R4 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC153Q494R4 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC153Q494R4 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC153Q494R4 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC153Q494R4 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC153Q494R4 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC153Q494R4 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC153Q494R4 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC153Q494R4 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC153Q494R4 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC153Q494R4 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC153Q494R4 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC153Q494R4 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC153Q494R4 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC153Q494R4 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC153Q494R4 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC153Q494R4 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC153Q494R4 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC153Q494R4 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC153Q494R4 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC153Q494R4 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC153Q494R4 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC153Q494R4 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC153Q494R4 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC153Q494R4 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC153Q494R4 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC153Q494R4 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC153Q494R4 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC153Q494R4 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC153Q494R4 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC153Q494R4 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC153Q494R4 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC153Q494R4 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC153Q494R4 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC153Q494R4 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC153Q494R4 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC153Q494R4 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC153Q494R4 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC153Q494R4 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC153Q494R4 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC153Q494R4 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC153Q494R4 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC153Q494R4 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC153Q494R4 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC153Q494R4 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC153Q494R4 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC153Q494R4 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC153Q494R4 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC153Q494R4 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC153Q494R4 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC153Q494R4 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC153Q494R4 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC153Q494R4 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC153Q494R4 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC153Q494R4 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC153Q494R4 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC153Q494R4 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC153Q494R4 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC153Q494R4 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC153Q494R4 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC153Q494R4 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC153Q494R4 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC153Q494R4 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC153Q494R4 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC153Q494R4 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC153Q494R4 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC153Q494R4 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC153Q494R4 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC153Q494R4 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC153Q494R4 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC153Q494R4 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC153Q494R4 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC153Q494R4 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC153Q494R4 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC153Q494R4 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC153Q494R4 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC153Q494R4 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC153Q494R4 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC153Q494R4 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC153Q494R4 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.4 ms