Protein–RNA interactions for Protein: Q3LHN0

KRTAP25-1, Keratin-associated protein 25-1, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP25-1Q3LHN0 CAMKV-215ENST00000488336 2905 ntTSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
KRTAP25-1Q3LHN0 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
KRTAP25-1Q3LHN0 SPTBN2-209ENST00000533211 8128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
KRTAP25-1Q3LHN0 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
KRTAP25-1Q3LHN0 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
KRTAP25-1Q3LHN0 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
KRTAP25-1Q3LHN0 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
KRTAP25-1Q3LHN0 ESYT3-202ENST00000389567 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
KRTAP25-1Q3LHN0 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
KRTAP25-1Q3LHN0 DNMT1-203ENST00000540357 4916 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
KRTAP25-1Q3LHN0 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
KRTAP25-1Q3LHN0 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
KRTAP25-1Q3LHN0 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC7.37□□□□□ -1.23
KRTAP25-1Q3LHN0 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
KRTAP25-1Q3LHN0 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
KRTAP25-1Q3LHN0 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC7.37□□□□□ -1.23
KRTAP25-1Q3LHN0 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
KRTAP25-1Q3LHN0 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
KRTAP25-1Q3LHN0 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC7.37□□□□□ -1.23
KRTAP25-1Q3LHN0 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
KRTAP25-1Q3LHN0 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
KRTAP25-1Q3LHN0 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
KRTAP25-1Q3LHN0 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
KRTAP25-1Q3LHN0 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
KRTAP25-1Q3LHN0 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
KRTAP25-1Q3LHN0 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
KRTAP25-1Q3LHN0 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
KRTAP25-1Q3LHN0 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
KRTAP25-1Q3LHN0 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
KRTAP25-1Q3LHN0 TLE3-208ENST00000557907 2295 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
KRTAP25-1Q3LHN0 COL1A1-201ENST00000225964 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
KRTAP25-1Q3LHN0 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
KRTAP25-1Q3LHN0 INTS6-201ENST00000311234 3662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
KRTAP25-1Q3LHN0 GAS8-201ENST00000268699 3185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
KRTAP25-1Q3LHN0 WDR81-205ENST00000437219 3184 ntTSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
KRTAP25-1Q3LHN0 TMEM136-202ENST00000375095 4143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
KRTAP25-1Q3LHN0 AKR1C8P-201ENST00000578467 2182 ntTSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
KRTAP25-1Q3LHN0 PBXIP1-203ENST00000368465 3144 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
KRTAP25-1Q3LHN0 PSMD11-201ENST00000261712 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
KRTAP25-1Q3LHN0 HPX-201ENST00000265983 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
KRTAP25-1Q3LHN0 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
KRTAP25-1Q3LHN0 KDM8-212ENST00000568965 1655 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
KRTAP25-1Q3LHN0 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
KRTAP25-1Q3LHN0 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
KRTAP25-1Q3LHN0 USP22-206ENST00000537526 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
KRTAP25-1Q3LHN0 STK25-235ENST00000543554 2556 ntTSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
KRTAP25-1Q3LHN0 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
KRTAP25-1Q3LHN0 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
KRTAP25-1Q3LHN0 TRPM5-201ENST00000155858 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
KRTAP25-1Q3LHN0 ESYT1-202ENST00000394048 4388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
KRTAP25-1Q3LHN0 CMIP-202ENST00000537098 4357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
KRTAP25-1Q3LHN0 PTGR2-204ENST00000555228 2543 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
KRTAP25-1Q3LHN0 ADAMTS13-202ENST00000356589 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
KRTAP25-1Q3LHN0 PPP1R15B-201ENST00000367188 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
KRTAP25-1Q3LHN0 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
KRTAP25-1Q3LHN0 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
KRTAP25-1Q3LHN0 MPRIP-202ENST00000341712 3846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
KRTAP25-1Q3LHN0 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
KRTAP25-1Q3LHN0 PNPLA8-208ENST00000453144 3366 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
KRTAP25-1Q3LHN0 TOR1AIP1-212ENST00000606911 8704 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
KRTAP25-1Q3LHN0 DSP-202ENST00000418664 7812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
KRTAP25-1Q3LHN0 MIR34AHG-203ENST00000635687 4211 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
KRTAP25-1Q3LHN0 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
KRTAP25-1Q3LHN0 TMEM130-203ENST00000416379 2881 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
KRTAP25-1Q3LHN0 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
KRTAP25-1Q3LHN0 HDAC7-203ENST00000380610 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
KRTAP25-1Q3LHN0 RBM15-204ENST00000617047 3284 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
KRTAP25-1Q3LHN0 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
KRTAP25-1Q3LHN0 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
KRTAP25-1Q3LHN0 SHANK2-211ENST00000449833 8850 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
KRTAP25-1Q3LHN0 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
KRTAP25-1Q3LHN0 RASA4CP-203ENST00000446874 3193 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
KRTAP25-1Q3LHN0 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
KRTAP25-1Q3LHN0 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
KRTAP25-1Q3LHN0 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
KRTAP25-1Q3LHN0 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
KRTAP25-1Q3LHN0 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
KRTAP25-1Q3LHN0 EXOC7-216ENST00000589210 4751 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
KRTAP25-1Q3LHN0 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
KRTAP25-1Q3LHN0 ANKRD49-210ENST00000544612 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
KRTAP25-1Q3LHN0 RTL10-202ENST00000405640 6785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
KRTAP25-1Q3LHN0 SNX19-211ENST00000533214 3096 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
KRTAP25-1Q3LHN0 PTGR2-205ENST00000555661 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
KRTAP25-1Q3LHN0 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
KRTAP25-1Q3LHN0 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
KRTAP25-1Q3LHN0 MKNK1-201ENST00000341183 2612 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
KRTAP25-1Q3LHN0 SUPT20HL1-201ENST00000436466 2618 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
KRTAP25-1Q3LHN0 KCNJ9-201ENST00000368088 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
KRTAP25-1Q3LHN0 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
KRTAP25-1Q3LHN0 IGHG4-202ENST00000641978 2597 ntAPPRIS P1 BASIC7.36□□□□□ -1.23
KRTAP25-1Q3LHN0 NMRAL2P-204ENST00000423298 1792 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
KRTAP25-1Q3LHN0 CACNA1G-226ENST00000513689 6879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
KRTAP25-1Q3LHN0 CACNA1G-228ENST00000514079 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
KRTAP25-1Q3LHN0 CACNA1G-231ENST00000515165 6870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
KRTAP25-1Q3LHN0 SSTR3-201ENST00000610913 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
KRTAP25-1Q3LHN0 GAS8-220ENST00000620723 3308 ntTSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
KRTAP25-1Q3LHN0 MTG2-201ENST00000370823 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
KRTAP25-1Q3LHN0 TMEM47-201ENST00000275954 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
KRTAP25-1Q3LHN0 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
KRTAP25-1Q3LHN0 ZNF570-201ENST00000330173 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms