Protein–RNA interactions for Protein: Q2TAA8

TSNAXIP1, Translin-associated factor X-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 658 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNAXIP1Q2TAA8 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TSNAXIP1Q2TAA8 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TSNAXIP1Q2TAA8 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TSNAXIP1Q2TAA8 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TSNAXIP1Q2TAA8 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TSNAXIP1Q2TAA8 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TSNAXIP1Q2TAA8 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TSNAXIP1Q2TAA8 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TSNAXIP1Q2TAA8 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TSNAXIP1Q2TAA8 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
TSNAXIP1Q2TAA8 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
TSNAXIP1Q2TAA8 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TSNAXIP1Q2TAA8 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
TSNAXIP1Q2TAA8 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TSNAXIP1Q2TAA8 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TSNAXIP1Q2TAA8 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
TSNAXIP1Q2TAA8 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TSNAXIP1Q2TAA8 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TSNAXIP1Q2TAA8 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TSNAXIP1Q2TAA8 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TSNAXIP1Q2TAA8 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
TSNAXIP1Q2TAA8 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TSNAXIP1Q2TAA8 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TSNAXIP1Q2TAA8 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TSNAXIP1Q2TAA8 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TSNAXIP1Q2TAA8 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TSNAXIP1Q2TAA8 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TSNAXIP1Q2TAA8 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
TSNAXIP1Q2TAA8 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
TSNAXIP1Q2TAA8 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TSNAXIP1Q2TAA8 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TSNAXIP1Q2TAA8 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TSNAXIP1Q2TAA8 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TSNAXIP1Q2TAA8 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TSNAXIP1Q2TAA8 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TSNAXIP1Q2TAA8 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TSNAXIP1Q2TAA8 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TSNAXIP1Q2TAA8 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
TSNAXIP1Q2TAA8 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TSNAXIP1Q2TAA8 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TSNAXIP1Q2TAA8 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TSNAXIP1Q2TAA8 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TSNAXIP1Q2TAA8 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TSNAXIP1Q2TAA8 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TSNAXIP1Q2TAA8 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TSNAXIP1Q2TAA8 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TSNAXIP1Q2TAA8 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TSNAXIP1Q2TAA8 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TSNAXIP1Q2TAA8 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TSNAXIP1Q2TAA8 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TSNAXIP1Q2TAA8 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TSNAXIP1Q2TAA8 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TSNAXIP1Q2TAA8 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TSNAXIP1Q2TAA8 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
TSNAXIP1Q2TAA8 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TSNAXIP1Q2TAA8 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
TSNAXIP1Q2TAA8 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TSNAXIP1Q2TAA8 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TSNAXIP1Q2TAA8 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TSNAXIP1Q2TAA8 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TSNAXIP1Q2TAA8 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TSNAXIP1Q2TAA8 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TSNAXIP1Q2TAA8 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TSNAXIP1Q2TAA8 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TSNAXIP1Q2TAA8 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TSNAXIP1Q2TAA8 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TSNAXIP1Q2TAA8 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TSNAXIP1Q2TAA8 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TSNAXIP1Q2TAA8 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TSNAXIP1Q2TAA8 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TSNAXIP1Q2TAA8 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TSNAXIP1Q2TAA8 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TSNAXIP1Q2TAA8 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TSNAXIP1Q2TAA8 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TSNAXIP1Q2TAA8 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TSNAXIP1Q2TAA8 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TSNAXIP1Q2TAA8 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TSNAXIP1Q2TAA8 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TSNAXIP1Q2TAA8 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TSNAXIP1Q2TAA8 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TSNAXIP1Q2TAA8 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TSNAXIP1Q2TAA8 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TSNAXIP1Q2TAA8 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TSNAXIP1Q2TAA8 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TSNAXIP1Q2TAA8 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TSNAXIP1Q2TAA8 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TSNAXIP1Q2TAA8 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TSNAXIP1Q2TAA8 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TSNAXIP1Q2TAA8 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TSNAXIP1Q2TAA8 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TSNAXIP1Q2TAA8 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TSNAXIP1Q2TAA8 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TSNAXIP1Q2TAA8 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TSNAXIP1Q2TAA8 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TSNAXIP1Q2TAA8 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TSNAXIP1Q2TAA8 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TSNAXIP1Q2TAA8 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TSNAXIP1Q2TAA8 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TSNAXIP1Q2TAA8 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TSNAXIP1Q2TAA8 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms