Protein–RNA interactions for Protein: Q17RN3

FAM98C, Protein FAM98C, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM98CQ17RN3 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
FAM98CQ17RN3 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
FAM98CQ17RN3 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
FAM98CQ17RN3 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
FAM98CQ17RN3 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
FAM98CQ17RN3 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
FAM98CQ17RN3 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
FAM98CQ17RN3 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
FAM98CQ17RN3 AQP8-202ENST00000566125 1276 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
FAM98CQ17RN3 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
FAM98CQ17RN3 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
FAM98CQ17RN3 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
FAM98CQ17RN3 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC20.65■□□□□ 0.9
FAM98CQ17RN3 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
FAM98CQ17RN3 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
FAM98CQ17RN3 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
FAM98CQ17RN3 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
FAM98CQ17RN3 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
FAM98CQ17RN3 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
FAM98CQ17RN3 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
FAM98CQ17RN3 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
FAM98CQ17RN3 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
FAM98CQ17RN3 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
FAM98CQ17RN3 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
FAM98CQ17RN3 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
FAM98CQ17RN3 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
FAM98CQ17RN3 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
FAM98CQ17RN3 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
FAM98CQ17RN3 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
FAM98CQ17RN3 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC20.64■□□□□ 0.9
FAM98CQ17RN3 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
FAM98CQ17RN3 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
FAM98CQ17RN3 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
FAM98CQ17RN3 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
FAM98CQ17RN3 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
FAM98CQ17RN3 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
FAM98CQ17RN3 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
FAM98CQ17RN3 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
FAM98CQ17RN3 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC20.64■□□□□ 0.89
FAM98CQ17RN3 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
FAM98CQ17RN3 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
FAM98CQ17RN3 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
FAM98CQ17RN3 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
FAM98CQ17RN3 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
FAM98CQ17RN3 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
FAM98CQ17RN3 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
FAM98CQ17RN3 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
FAM98CQ17RN3 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
FAM98CQ17RN3 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
FAM98CQ17RN3 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
FAM98CQ17RN3 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
FAM98CQ17RN3 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FAM98CQ17RN3 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
FAM98CQ17RN3 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FAM98CQ17RN3 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
FAM98CQ17RN3 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
FAM98CQ17RN3 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FAM98CQ17RN3 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FAM98CQ17RN3 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FAM98CQ17RN3 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
FAM98CQ17RN3 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FAM98CQ17RN3 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
FAM98CQ17RN3 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FAM98CQ17RN3 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FAM98CQ17RN3 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FAM98CQ17RN3 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FAM98CQ17RN3 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FAM98CQ17RN3 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
FAM98CQ17RN3 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
FAM98CQ17RN3 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
FAM98CQ17RN3 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FAM98CQ17RN3 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
FAM98CQ17RN3 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
FAM98CQ17RN3 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
FAM98CQ17RN3 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
FAM98CQ17RN3 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FAM98CQ17RN3 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FAM98CQ17RN3 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FAM98CQ17RN3 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
FAM98CQ17RN3 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
FAM98CQ17RN3 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
FAM98CQ17RN3 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FAM98CQ17RN3 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FAM98CQ17RN3 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
FAM98CQ17RN3 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
FAM98CQ17RN3 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
FAM98CQ17RN3 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
FAM98CQ17RN3 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
FAM98CQ17RN3 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
FAM98CQ17RN3 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
FAM98CQ17RN3 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
FAM98CQ17RN3 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
FAM98CQ17RN3 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FAM98CQ17RN3 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
FAM98CQ17RN3 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
FAM98CQ17RN3 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
FAM98CQ17RN3 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FAM98CQ17RN3 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
FAM98CQ17RN3 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FAM98CQ17RN3 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms