Protein–RNA interactions for Protein: Q16873

LTC4S, Leukotriene C4 synthase, humanhuman

Predictions only

Length 150 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTC4SQ16873 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
LTC4SQ16873 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
LTC4SQ16873 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
LTC4SQ16873 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
LTC4SQ16873 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
LTC4SQ16873 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
LTC4SQ16873 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
LTC4SQ16873 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
LTC4SQ16873 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
LTC4SQ16873 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.52□□□□□ -0.25
LTC4SQ16873 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
LTC4SQ16873 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
LTC4SQ16873 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
LTC4SQ16873 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
LTC4SQ16873 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC13.52□□□□□ -0.25
LTC4SQ16873 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
LTC4SQ16873 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
LTC4SQ16873 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
LTC4SQ16873 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
LTC4SQ16873 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
LTC4SQ16873 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
LTC4SQ16873 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
LTC4SQ16873 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
LTC4SQ16873 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
LTC4SQ16873 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
LTC4SQ16873 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
LTC4SQ16873 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
LTC4SQ16873 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
LTC4SQ16873 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
LTC4SQ16873 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
LTC4SQ16873 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
LTC4SQ16873 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
LTC4SQ16873 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
LTC4SQ16873 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
LTC4SQ16873 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
LTC4SQ16873 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
LTC4SQ16873 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
LTC4SQ16873 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
LTC4SQ16873 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
LTC4SQ16873 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LTC4SQ16873 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LTC4SQ16873 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LTC4SQ16873 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LTC4SQ16873 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LTC4SQ16873 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LTC4SQ16873 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LTC4SQ16873 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LTC4SQ16873 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LTC4SQ16873 OPA1-202ENST00000361510 6492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LTC4SQ16873 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
LTC4SQ16873 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LTC4SQ16873 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LTC4SQ16873 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LTC4SQ16873 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LTC4SQ16873 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LTC4SQ16873 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LTC4SQ16873 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LTC4SQ16873 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LTC4SQ16873 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LTC4SQ16873 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LTC4SQ16873 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LTC4SQ16873 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LTC4SQ16873 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LTC4SQ16873 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LTC4SQ16873 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LTC4SQ16873 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LTC4SQ16873 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LTC4SQ16873 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LTC4SQ16873 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LTC4SQ16873 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LTC4SQ16873 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LTC4SQ16873 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LTC4SQ16873 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LTC4SQ16873 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
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LTC4SQ16873 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LTC4SQ16873 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LTC4SQ16873 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LTC4SQ16873 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LTC4SQ16873 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LTC4SQ16873 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LTC4SQ16873 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LTC4SQ16873 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LTC4SQ16873 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LTC4SQ16873 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LTC4SQ16873 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LTC4SQ16873 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LTC4SQ16873 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LTC4SQ16873 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LTC4SQ16873 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
LTC4SQ16873 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LTC4SQ16873 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LTC4SQ16873 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LTC4SQ16873 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LTC4SQ16873 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LTC4SQ16873 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LTC4SQ16873 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LTC4SQ16873 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LTC4SQ16873 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LTC4SQ16873 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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