Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ECM1Q16610 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ECM1Q16610 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ECM1Q16610 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ECM1Q16610 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ECM1Q16610 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ECM1Q16610 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ECM1Q16610 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ECM1Q16610 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ECM1Q16610 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ECM1Q16610 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ECM1Q16610 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ECM1Q16610 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ECM1Q16610 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ECM1Q16610 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ECM1Q16610 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ECM1Q16610 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ECM1Q16610 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ECM1Q16610 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ECM1Q16610 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ECM1Q16610 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ECM1Q16610 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ECM1Q16610 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ECM1Q16610 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ECM1Q16610 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ECM1Q16610 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ECM1Q16610 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ECM1Q16610 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ECM1Q16610 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ECM1Q16610 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ECM1Q16610 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ECM1Q16610 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ECM1Q16610 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ECM1Q16610 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ECM1Q16610 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ECM1Q16610 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ECM1Q16610 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ECM1Q16610 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ECM1Q16610 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ECM1Q16610 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ECM1Q16610 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ECM1Q16610 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ECM1Q16610 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ECM1Q16610 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ECM1Q16610 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ECM1Q16610 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ECM1Q16610 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ECM1Q16610 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ECM1Q16610 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ECM1Q16610 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ECM1Q16610 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ECM1Q16610 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ECM1Q16610 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ECM1Q16610 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ECM1Q16610 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ECM1Q16610 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ECM1Q16610 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ECM1Q16610 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ECM1Q16610 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ECM1Q16610 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ECM1Q16610 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ECM1Q16610 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ECM1Q16610 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ECM1Q16610 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ECM1Q16610 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ECM1Q16610 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ECM1Q16610 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ECM1Q16610 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ECM1Q16610 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ECM1Q16610 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ECM1Q16610 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ECM1Q16610 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ECM1Q16610 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ECM1Q16610 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
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ECM1Q16610 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
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ECM1Q16610 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ECM1Q16610 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ECM1Q16610 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ECM1Q16610 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ECM1Q16610 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ECM1Q16610 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ECM1Q16610 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ECM1Q16610 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ECM1Q16610 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ECM1Q16610 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ECM1Q16610 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ECM1Q16610 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ECM1Q16610 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ECM1Q16610 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ECM1Q16610 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ECM1Q16610 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ECM1Q16610 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ECM1Q16610 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ECM1Q16610 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
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