Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPE65Q16518 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPE65Q16518 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPE65Q16518 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPE65Q16518 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPE65Q16518 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPE65Q16518 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPE65Q16518 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPE65Q16518 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPE65Q16518 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPE65Q16518 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPE65Q16518 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPE65Q16518 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPE65Q16518 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPE65Q16518 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPE65Q16518 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPE65Q16518 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPE65Q16518 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPE65Q16518 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPE65Q16518 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
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RPE65Q16518 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPE65Q16518 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPE65Q16518 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPE65Q16518 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPE65Q16518 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RPE65Q16518 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPE65Q16518 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPE65Q16518 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPE65Q16518 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPE65Q16518 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPE65Q16518 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPE65Q16518 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPE65Q16518 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPE65Q16518 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPE65Q16518 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPE65Q16518 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPE65Q16518 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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RPE65Q16518 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPE65Q16518 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPE65Q16518 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPE65Q16518 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPE65Q16518 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPE65Q16518 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPE65Q16518 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPE65Q16518 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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RPE65Q16518 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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RPE65Q16518 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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RPE65Q16518 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
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RPE65Q16518 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
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RPE65Q16518 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RPE65Q16518 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RPE65Q16518 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RPE65Q16518 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RPE65Q16518 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RPE65Q16518 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RPE65Q16518 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RPE65Q16518 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RPE65Q16518 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RPE65Q16518 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RPE65Q16518 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RPE65Q16518 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RPE65Q16518 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RPE65Q16518 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RPE65Q16518 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
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