Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC6Q16204 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC6Q16204 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC6Q16204 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC6Q16204 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC6Q16204 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC6Q16204 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC6Q16204 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC6Q16204 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC6Q16204 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC6Q16204 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC6Q16204 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC6Q16204 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC6Q16204 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC6Q16204 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC6Q16204 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC6Q16204 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC6Q16204 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC6Q16204 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC6Q16204 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC6Q16204 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC6Q16204 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC6Q16204 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC6Q16204 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC6Q16204 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC6Q16204 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC6Q16204 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC6Q16204 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC6Q16204 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC6Q16204 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC6Q16204 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC6Q16204 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
CCDC6Q16204 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.3
CCDC6Q16204 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.3
CCDC6Q16204 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
CCDC6Q16204 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
CCDC6Q16204 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
CCDC6Q16204 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC6Q16204 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC6Q16204 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC6Q16204 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC6Q16204 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC6Q16204 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC6Q16204 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC6Q16204 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC6Q16204 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC6Q16204 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC6Q16204 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC6Q16204 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC6Q16204 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC6Q16204 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC6Q16204 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC6Q16204 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC6Q16204 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC6Q16204 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC6Q16204 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC6Q16204 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC6Q16204 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC6Q16204 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC6Q16204 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC6Q16204 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC6Q16204 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC6Q16204 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC6Q16204 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC6Q16204 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC6Q16204 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC6Q16204 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC6Q16204 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC6Q16204 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC6Q16204 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC6Q16204 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC6Q16204 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC6Q16204 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC6Q16204 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC6Q16204 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC6Q16204 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC6Q16204 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC6Q16204 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC6Q16204 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC6Q16204 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC6Q16204 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC6Q16204 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC6Q16204 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC6Q16204 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC6Q16204 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC6Q16204 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC6Q16204 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC6Q16204 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC6Q16204 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC6Q16204 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC6Q16204 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC6Q16204 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC6Q16204 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC6Q16204 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC6Q16204 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC6Q16204 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC6Q16204 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC6Q16204 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC6Q16204 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC6Q16204 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
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