Protein–RNA interactions for Protein: Q15672

TWIST1, Twist-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWIST1Q15672 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
TWIST1Q15672 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
TWIST1Q15672 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
TWIST1Q15672 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
TWIST1Q15672 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
TWIST1Q15672 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
TWIST1Q15672 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
TWIST1Q15672 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
TWIST1Q15672 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
TWIST1Q15672 SERTAD2-201ENST00000313349 5549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
TWIST1Q15672 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
TWIST1Q15672 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
TWIST1Q15672 MAPKAPK5-206ENST00000550735 11349 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
TWIST1Q15672 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
TWIST1Q15672 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
TWIST1Q15672 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
TWIST1Q15672 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
TWIST1Q15672 BRWD1-201ENST00000333229 10141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
TWIST1Q15672 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
TWIST1Q15672 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
TWIST1Q15672 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
TWIST1Q15672 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
TWIST1Q15672 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
TWIST1Q15672 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
TWIST1Q15672 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
TWIST1Q15672 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
TWIST1Q15672 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
TWIST1Q15672 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
TWIST1Q15672 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
TWIST1Q15672 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
TWIST1Q15672 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
TWIST1Q15672 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
TWIST1Q15672 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
TWIST1Q15672 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
TWIST1Q15672 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC12.01□□□□□ -0.49
TWIST1Q15672 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
TWIST1Q15672 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
TWIST1Q15672 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
TWIST1Q15672 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
TWIST1Q15672 PCDHB16-201ENST00000609684 5001 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
TWIST1Q15672 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
TWIST1Q15672 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
TWIST1Q15672 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
TWIST1Q15672 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
TWIST1Q15672 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
TWIST1Q15672 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
TWIST1Q15672 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
TWIST1Q15672 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
TWIST1Q15672 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
TWIST1Q15672 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
TWIST1Q15672 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
TWIST1Q15672 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
TWIST1Q15672 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
TWIST1Q15672 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
TWIST1Q15672 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
TWIST1Q15672 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
TWIST1Q15672 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
TWIST1Q15672 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
TWIST1Q15672 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
TWIST1Q15672 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
TWIST1Q15672 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
TWIST1Q15672 NCOR2-202ENST00000404121 7175 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
TWIST1Q15672 MYO16-203ENST00000357550 6779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
TWIST1Q15672 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
TWIST1Q15672 GRIP2-204ENST00000619221 7977 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
TWIST1Q15672 ARAP3-201ENST00000239440 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
TWIST1Q15672 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
TWIST1Q15672 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
TWIST1Q15672 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
TWIST1Q15672 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
TWIST1Q15672 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
TWIST1Q15672 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
TWIST1Q15672 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
TWIST1Q15672 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
TWIST1Q15672 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
TWIST1Q15672 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
TWIST1Q15672 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
TWIST1Q15672 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
TWIST1Q15672 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
TWIST1Q15672 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
TWIST1Q15672 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
TWIST1Q15672 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TWIST1Q15672 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TWIST1Q15672 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TWIST1Q15672 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
TWIST1Q15672 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TWIST1Q15672 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
TWIST1Q15672 SAMD4A-202ENST00000392067 6833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
TWIST1Q15672 AFDN-211ENST00000447894 5475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
TWIST1Q15672 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
TWIST1Q15672 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
TWIST1Q15672 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TWIST1Q15672 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TWIST1Q15672 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
TWIST1Q15672 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TWIST1Q15672 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TWIST1Q15672 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TWIST1Q15672 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TWIST1Q15672 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
TWIST1Q15672 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms