Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

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Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTPRKQ15262 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTPRKQ15262 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTPRKQ15262 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
PTPRKQ15262 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTPRKQ15262 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
PTPRKQ15262 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTPRKQ15262 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTPRKQ15262 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTPRKQ15262 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTPRKQ15262 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTPRKQ15262 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTPRKQ15262 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTPRKQ15262 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTPRKQ15262 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTPRKQ15262 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
PTPRKQ15262 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTPRKQ15262 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTPRKQ15262 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTPRKQ15262 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTPRKQ15262 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTPRKQ15262 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTPRKQ15262 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTPRKQ15262 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTPRKQ15262 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTPRKQ15262 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
PTPRKQ15262 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTPRKQ15262 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTPRKQ15262 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTPRKQ15262 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTPRKQ15262 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
PTPRKQ15262 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTPRKQ15262 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTPRKQ15262 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTPRKQ15262 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTPRKQ15262 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTPRKQ15262 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTPRKQ15262 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTPRKQ15262 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTPRKQ15262 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTPRKQ15262 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTPRKQ15262 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTPRKQ15262 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTPRKQ15262 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTPRKQ15262 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTPRKQ15262 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTPRKQ15262 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTPRKQ15262 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTPRKQ15262 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTPRKQ15262 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTPRKQ15262 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPRKQ15262 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPRKQ15262 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPRKQ15262 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPRKQ15262 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPRKQ15262 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPRKQ15262 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPRKQ15262 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPRKQ15262 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPRKQ15262 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPRKQ15262 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPRKQ15262 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPRKQ15262 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPRKQ15262 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPRKQ15262 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPRKQ15262 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPRKQ15262 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPRKQ15262 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPRKQ15262 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPRKQ15262 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPRKQ15262 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPRKQ15262 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPRKQ15262 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPRKQ15262 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPRKQ15262 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPRKQ15262 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPRKQ15262 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPRKQ15262 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPRKQ15262 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPRKQ15262 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPRKQ15262 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPRKQ15262 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPRKQ15262 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPRKQ15262 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPRKQ15262 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPRKQ15262 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPRKQ15262 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPRKQ15262 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPRKQ15262 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPRKQ15262 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPRKQ15262 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPRKQ15262 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPRKQ15262 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPRKQ15262 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPRKQ15262 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPRKQ15262 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTPRKQ15262 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTPRKQ15262 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTPRKQ15262 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTPRKQ15262 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
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