Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LAPTM4AQ15012 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LAPTM4AQ15012 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
LAPTM4AQ15012 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LAPTM4AQ15012 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
LAPTM4AQ15012 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
LAPTM4AQ15012 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LAPTM4AQ15012 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LAPTM4AQ15012 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LAPTM4AQ15012 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LAPTM4AQ15012 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
LAPTM4AQ15012 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
LAPTM4AQ15012 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LAPTM4AQ15012 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
LAPTM4AQ15012 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
LAPTM4AQ15012 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
LAPTM4AQ15012 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
LAPTM4AQ15012 AC024475.1-201ENST00000528480 605 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
LAPTM4AQ15012 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
LAPTM4AQ15012 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
LAPTM4AQ15012 AC009269.5-201ENST00000557800 755 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
LAPTM4AQ15012 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC15.05■□□□□ -0
LAPTM4AQ15012 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC15.05■□□□□ -0
LAPTM4AQ15012 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC15.05■□□□□ -0
LAPTM4AQ15012 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC15.05■□□□□ -0
LAPTM4AQ15012 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC15.05■□□□□ -0
LAPTM4AQ15012 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC15.05■□□□□ -0
LAPTM4AQ15012 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LAPTM4AQ15012 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
LAPTM4AQ15012 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
LAPTM4AQ15012 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
LAPTM4AQ15012 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
LAPTM4AQ15012 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LAPTM4AQ15012 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LAPTM4AQ15012 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LAPTM4AQ15012 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LAPTM4AQ15012 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LAPTM4AQ15012 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LAPTM4AQ15012 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LAPTM4AQ15012 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LAPTM4AQ15012 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
LAPTM4AQ15012 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LAPTM4AQ15012 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LAPTM4AQ15012 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
LAPTM4AQ15012 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LAPTM4AQ15012 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LAPTM4AQ15012 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
LAPTM4AQ15012 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LAPTM4AQ15012 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
LAPTM4AQ15012 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LAPTM4AQ15012 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
LAPTM4AQ15012 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LAPTM4AQ15012 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LAPTM4AQ15012 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LAPTM4AQ15012 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LAPTM4AQ15012 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LAPTM4AQ15012 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LAPTM4AQ15012 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LAPTM4AQ15012 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LAPTM4AQ15012 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LAPTM4AQ15012 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LAPTM4AQ15012 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LAPTM4AQ15012 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LAPTM4AQ15012 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LAPTM4AQ15012 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LAPTM4AQ15012 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LAPTM4AQ15012 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LAPTM4AQ15012 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LAPTM4AQ15012 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LAPTM4AQ15012 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC15.04■□□□□ -0
LAPTM4AQ15012 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC15.04■□□□□ -0
LAPTM4AQ15012 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
LAPTM4AQ15012 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LAPTM4AQ15012 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LAPTM4AQ15012 IFNA1-201ENST00000276927 863 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
LAPTM4AQ15012 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
LAPTM4AQ15012 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
LAPTM4AQ15012 ARAF-202ENST00000377039 1271 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LAPTM4AQ15012 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LAPTM4AQ15012 EIF2S2P3-201ENST00000428356 999 ntBASIC15.04■□□□□ -0
LAPTM4AQ15012 KCNQ5-IT1-201ENST00000445310 563 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LAPTM4AQ15012 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
LAPTM4AQ15012 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LAPTM4AQ15012 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
LAPTM4AQ15012 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LAPTM4AQ15012 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
LAPTM4AQ15012 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
LAPTM4AQ15012 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LAPTM4AQ15012 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC15.04■□□□□ -0
LAPTM4AQ15012 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC15.04■□□□□ -0
LAPTM4AQ15012 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC15.04■□□□□ -0
LAPTM4AQ15012 AC133485.6-201ENST00000624045 688 ntBASIC15.04■□□□□ -0
LAPTM4AQ15012 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC15.04■□□□□ -0
LAPTM4AQ15012 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LAPTM4AQ15012 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LAPTM4AQ15012 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC15.04■□□□□ -0
LAPTM4AQ15012 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LAPTM4AQ15012 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LAPTM4AQ15012 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LAPTM4AQ15012 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.1 ms