Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

Predictions only

Length 1,683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SHPRHQ149N8 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SHPRHQ149N8 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SHPRHQ149N8 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SHPRHQ149N8 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SHPRHQ149N8 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SHPRHQ149N8 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SHPRHQ149N8 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SHPRHQ149N8 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SHPRHQ149N8 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SHPRHQ149N8 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SHPRHQ149N8 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SHPRHQ149N8 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SHPRHQ149N8 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SHPRHQ149N8 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SHPRHQ149N8 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SHPRHQ149N8 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SHPRHQ149N8 COX10-AS1-206ENST00000602743 576 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SHPRHQ149N8 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SHPRHQ149N8 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SHPRHQ149N8 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SHPRHQ149N8 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SHPRHQ149N8 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SHPRHQ149N8 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SHPRHQ149N8 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SHPRHQ149N8 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SHPRHQ149N8 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SHPRHQ149N8 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SHPRHQ149N8 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SHPRHQ149N8 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SHPRHQ149N8 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SHPRHQ149N8 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SHPRHQ149N8 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SHPRHQ149N8 AP000894.2-204ENST00000577358 473 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SHPRHQ149N8 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SHPRHQ149N8 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SHPRHQ149N8 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SHPRHQ149N8 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SHPRHQ149N8 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SHPRHQ149N8 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SHPRHQ149N8 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SHPRHQ149N8 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SHPRHQ149N8 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SHPRHQ149N8 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SHPRHQ149N8 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SHPRHQ149N8 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SHPRHQ149N8 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SHPRHQ149N8 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SHPRHQ149N8 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SHPRHQ149N8 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SHPRHQ149N8 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SHPRHQ149N8 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SHPRHQ149N8 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SHPRHQ149N8 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SHPRHQ149N8 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SHPRHQ149N8 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SHPRHQ149N8 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SHPRHQ149N8 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SHPRHQ149N8 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SHPRHQ149N8 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SHPRHQ149N8 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SHPRHQ149N8 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SHPRHQ149N8 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SHPRHQ149N8 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SHPRHQ149N8 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SHPRHQ149N8 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SHPRHQ149N8 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SHPRHQ149N8 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SHPRHQ149N8 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SHPRHQ149N8 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SHPRHQ149N8 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SHPRHQ149N8 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SHPRHQ149N8 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SHPRHQ149N8 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SHPRHQ149N8 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SHPRHQ149N8 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SHPRHQ149N8 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SHPRHQ149N8 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SHPRHQ149N8 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SHPRHQ149N8 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SHPRHQ149N8 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SHPRHQ149N8 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SHPRHQ149N8 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SHPRHQ149N8 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SHPRHQ149N8 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SHPRHQ149N8 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SHPRHQ149N8 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SHPRHQ149N8 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SHPRHQ149N8 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SHPRHQ149N8 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SHPRHQ149N8 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SHPRHQ149N8 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SHPRHQ149N8 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SHPRHQ149N8 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SHPRHQ149N8 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SHPRHQ149N8 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SHPRHQ149N8 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SHPRHQ149N8 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SHPRHQ149N8 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SHPRHQ149N8 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.8 ms