Protein–RNA interactions for Protein: Q14993

COL19A1, Collagen alpha-1(XIX) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL19A1Q14993 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
COL19A1Q14993 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
COL19A1Q14993 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COL19A1Q14993 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
COL19A1Q14993 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COL19A1Q14993 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COL19A1Q14993 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
COL19A1Q14993 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
COL19A1Q14993 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COL19A1Q14993 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
COL19A1Q14993 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COL19A1Q14993 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
COL19A1Q14993 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
COL19A1Q14993 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COL19A1Q14993 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
COL19A1Q14993 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COL19A1Q14993 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COL19A1Q14993 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COL19A1Q14993 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COL19A1Q14993 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
COL19A1Q14993 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COL19A1Q14993 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
COL19A1Q14993 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COL19A1Q14993 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COL19A1Q14993 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
COL19A1Q14993 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
COL19A1Q14993 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COL19A1Q14993 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
COL19A1Q14993 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
COL19A1Q14993 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
COL19A1Q14993 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
COL19A1Q14993 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
COL19A1Q14993 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COL19A1Q14993 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
COL19A1Q14993 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
COL19A1Q14993 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COL19A1Q14993 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COL19A1Q14993 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COL19A1Q14993 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
COL19A1Q14993 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COL19A1Q14993 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COL19A1Q14993 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COL19A1Q14993 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COL19A1Q14993 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COL19A1Q14993 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COL19A1Q14993 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COL19A1Q14993 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
COL19A1Q14993 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
COL19A1Q14993 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
COL19A1Q14993 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
COL19A1Q14993 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
COL19A1Q14993 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
COL19A1Q14993 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
COL19A1Q14993 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
COL19A1Q14993 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
COL19A1Q14993 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
COL19A1Q14993 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
COL19A1Q14993 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
COL19A1Q14993 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
COL19A1Q14993 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
COL19A1Q14993 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
COL19A1Q14993 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
COL19A1Q14993 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
COL19A1Q14993 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
COL19A1Q14993 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
COL19A1Q14993 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
COL19A1Q14993 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
COL19A1Q14993 AC018635.2-201ENST00000608625 364 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
COL19A1Q14993 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
COL19A1Q14993 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
COL19A1Q14993 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
COL19A1Q14993 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
COL19A1Q14993 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
COL19A1Q14993 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
COL19A1Q14993 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
COL19A1Q14993 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
COL19A1Q14993 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
COL19A1Q14993 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
COL19A1Q14993 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
COL19A1Q14993 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
COL19A1Q14993 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
COL19A1Q14993 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
COL19A1Q14993 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
COL19A1Q14993 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
COL19A1Q14993 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
COL19A1Q14993 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
COL19A1Q14993 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
COL19A1Q14993 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
COL19A1Q14993 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
COL19A1Q14993 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
COL19A1Q14993 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
COL19A1Q14993 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
COL19A1Q14993 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
COL19A1Q14993 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
COL19A1Q14993 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
COL19A1Q14993 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
COL19A1Q14993 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
COL19A1Q14993 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
COL19A1Q14993 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
COL19A1Q14993 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms