Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAB39AQ14964 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAB39AQ14964 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
RAB39AQ14964 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RAB39AQ14964 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAB39AQ14964 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAB39AQ14964 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
RAB39AQ14964 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RAB39AQ14964 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAB39AQ14964 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAB39AQ14964 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAB39AQ14964 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RAB39AQ14964 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAB39AQ14964 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAB39AQ14964 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAB39AQ14964 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RAB39AQ14964 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RAB39AQ14964 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RAB39AQ14964 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RAB39AQ14964 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RAB39AQ14964 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RAB39AQ14964 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
RAB39AQ14964 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
RAB39AQ14964 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
RAB39AQ14964 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RAB39AQ14964 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
RAB39AQ14964 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RAB39AQ14964 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAB39AQ14964 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAB39AQ14964 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAB39AQ14964 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RAB39AQ14964 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RAB39AQ14964 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RAB39AQ14964 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAB39AQ14964 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAB39AQ14964 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAB39AQ14964 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RAB39AQ14964 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAB39AQ14964 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RAB39AQ14964 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAB39AQ14964 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RAB39AQ14964 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RAB39AQ14964 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAB39AQ14964 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAB39AQ14964 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RAB39AQ14964 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RAB39AQ14964 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RAB39AQ14964 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAB39AQ14964 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAB39AQ14964 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RAB39AQ14964 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RAB39AQ14964 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RAB39AQ14964 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAB39AQ14964 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAB39AQ14964 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
RAB39AQ14964 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAB39AQ14964 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
RAB39AQ14964 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAB39AQ14964 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAB39AQ14964 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
RAB39AQ14964 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC15.03■□□□□ -0
RAB39AQ14964 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
RAB39AQ14964 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAB39AQ14964 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
RAB39AQ14964 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC15.03■□□□□ -0
RAB39AQ14964 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC15.03■□□□□ -0
RAB39AQ14964 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAB39AQ14964 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RAB39AQ14964 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAB39AQ14964 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAB39AQ14964 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAB39AQ14964 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAB39AQ14964 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RAB39AQ14964 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAB39AQ14964 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAB39AQ14964 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAB39AQ14964 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RAB39AQ14964 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAB39AQ14964 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAB39AQ14964 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAB39AQ14964 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RAB39AQ14964 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RAB39AQ14964 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RAB39AQ14964 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAB39AQ14964 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RAB39AQ14964 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RAB39AQ14964 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAB39AQ14964 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC15.03■□□□□ -0
RAB39AQ14964 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAB39AQ14964 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
RAB39AQ14964 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RAB39AQ14964 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
RAB39AQ14964 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RAB39AQ14964 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RAB39AQ14964 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RAB39AQ14964 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RAB39AQ14964 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
RAB39AQ14964 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
RAB39AQ14964 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RAB39AQ14964 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms