Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMC1AQ14683 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMC1AQ14683 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMC1AQ14683 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMC1AQ14683 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMC1AQ14683 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMC1AQ14683 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMC1AQ14683 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMC1AQ14683 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SMC1AQ14683 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMC1AQ14683 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SMC1AQ14683 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SMC1AQ14683 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMC1AQ14683 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SMC1AQ14683 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMC1AQ14683 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMC1AQ14683 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SMC1AQ14683 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SMC1AQ14683 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SMC1AQ14683 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMC1AQ14683 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMC1AQ14683 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMC1AQ14683 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMC1AQ14683 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMC1AQ14683 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMC1AQ14683 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMC1AQ14683 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMC1AQ14683 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SMC1AQ14683 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
SMC1AQ14683 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SMC1AQ14683 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SMC1AQ14683 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
SMC1AQ14683 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SMC1AQ14683 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SMC1AQ14683 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SMC1AQ14683 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SMC1AQ14683 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SMC1AQ14683 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SMC1AQ14683 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SMC1AQ14683 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMC1AQ14683 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SMC1AQ14683 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMC1AQ14683 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMC1AQ14683 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SMC1AQ14683 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SMC1AQ14683 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMC1AQ14683 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMC1AQ14683 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMC1AQ14683 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMC1AQ14683 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMC1AQ14683 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMC1AQ14683 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMC1AQ14683 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMC1AQ14683 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMC1AQ14683 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMC1AQ14683 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMC1AQ14683 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMC1AQ14683 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMC1AQ14683 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMC1AQ14683 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMC1AQ14683 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMC1AQ14683 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMC1AQ14683 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMC1AQ14683 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMC1AQ14683 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMC1AQ14683 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMC1AQ14683 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SMC1AQ14683 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMC1AQ14683 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMC1AQ14683 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMC1AQ14683 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMC1AQ14683 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMC1AQ14683 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMC1AQ14683 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMC1AQ14683 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SMC1AQ14683 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SMC1AQ14683 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SMC1AQ14683 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMC1AQ14683 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMC1AQ14683 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMC1AQ14683 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMC1AQ14683 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMC1AQ14683 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SMC1AQ14683 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMC1AQ14683 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMC1AQ14683 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMC1AQ14683 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMC1AQ14683 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMC1AQ14683 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMC1AQ14683 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMC1AQ14683 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMC1AQ14683 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMC1AQ14683 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMC1AQ14683 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMC1AQ14683 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMC1AQ14683 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMC1AQ14683 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMC1AQ14683 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMC1AQ14683 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMC1AQ14683 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
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