Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RUNX3Q13761 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RUNX3Q13761 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RUNX3Q13761 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RUNX3Q13761 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RUNX3Q13761 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RUNX3Q13761 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RUNX3Q13761 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RUNX3Q13761 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RUNX3Q13761 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RUNX3Q13761 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
RUNX3Q13761 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
RUNX3Q13761 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
RUNX3Q13761 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
RUNX3Q13761 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
RUNX3Q13761 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RUNX3Q13761 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RUNX3Q13761 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
RUNX3Q13761 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RUNX3Q13761 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RUNX3Q13761 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RUNX3Q13761 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RUNX3Q13761 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RUNX3Q13761 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RUNX3Q13761 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RUNX3Q13761 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RUNX3Q13761 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RUNX3Q13761 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
RUNX3Q13761 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RUNX3Q13761 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RUNX3Q13761 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RUNX3Q13761 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
RUNX3Q13761 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RUNX3Q13761 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RUNX3Q13761 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RUNX3Q13761 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
RUNX3Q13761 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RUNX3Q13761 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RUNX3Q13761 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RUNX3Q13761 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RUNX3Q13761 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RUNX3Q13761 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RUNX3Q13761 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RUNX3Q13761 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RUNX3Q13761 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RUNX3Q13761 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RUNX3Q13761 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RUNX3Q13761 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RUNX3Q13761 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RUNX3Q13761 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RUNX3Q13761 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RUNX3Q13761 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RUNX3Q13761 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RUNX3Q13761 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RUNX3Q13761 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RUNX3Q13761 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RUNX3Q13761 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RUNX3Q13761 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RUNX3Q13761 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RUNX3Q13761 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RUNX3Q13761 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RUNX3Q13761 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RUNX3Q13761 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RUNX3Q13761 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RUNX3Q13761 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RUNX3Q13761 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RUNX3Q13761 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RUNX3Q13761 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RUNX3Q13761 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RUNX3Q13761 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RUNX3Q13761 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RUNX3Q13761 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RUNX3Q13761 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RUNX3Q13761 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RUNX3Q13761 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RUNX3Q13761 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RUNX3Q13761 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RUNX3Q13761 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RUNX3Q13761 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RUNX3Q13761 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RUNX3Q13761 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RUNX3Q13761 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RUNX3Q13761 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RUNX3Q13761 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RUNX3Q13761 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RUNX3Q13761 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RUNX3Q13761 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RUNX3Q13761 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RUNX3Q13761 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RUNX3Q13761 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RUNX3Q13761 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RUNX3Q13761 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RUNX3Q13761 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RUNX3Q13761 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RUNX3Q13761 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RUNX3Q13761 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RUNX3Q13761 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RUNX3Q13761 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RUNX3Q13761 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RUNX3Q13761 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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