Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

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Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CUL4AQ13619 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CUL4AQ13619 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CUL4AQ13619 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CUL4AQ13619 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CUL4AQ13619 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CUL4AQ13619 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CUL4AQ13619 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CUL4AQ13619 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CUL4AQ13619 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CUL4AQ13619 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CUL4AQ13619 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CUL4AQ13619 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CUL4AQ13619 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CUL4AQ13619 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CUL4AQ13619 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CUL4AQ13619 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CUL4AQ13619 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CUL4AQ13619 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CUL4AQ13619 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CUL4AQ13619 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CUL4AQ13619 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CUL4AQ13619 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CUL4AQ13619 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CUL4AQ13619 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CUL4AQ13619 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CUL4AQ13619 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CUL4AQ13619 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CUL4AQ13619 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CUL4AQ13619 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CUL4AQ13619 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CUL4AQ13619 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CUL4AQ13619 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CUL4AQ13619 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CUL4AQ13619 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CUL4AQ13619 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CUL4AQ13619 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CUL4AQ13619 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CUL4AQ13619 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CUL4AQ13619 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CUL4AQ13619 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CUL4AQ13619 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CUL4AQ13619 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CUL4AQ13619 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CUL4AQ13619 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CUL4AQ13619 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CUL4AQ13619 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CUL4AQ13619 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CUL4AQ13619 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CUL4AQ13619 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CUL4AQ13619 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CUL4AQ13619 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CUL4AQ13619 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CUL4AQ13619 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CUL4AQ13619 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CUL4AQ13619 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CUL4AQ13619 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CUL4AQ13619 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CUL4AQ13619 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
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CUL4AQ13619 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CUL4AQ13619 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CUL4AQ13619 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CUL4AQ13619 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CUL4AQ13619 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
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CUL4AQ13619 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CUL4AQ13619 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CUL4AQ13619 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CUL4AQ13619 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CUL4AQ13619 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CUL4AQ13619 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CUL4AQ13619 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CUL4AQ13619 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CUL4AQ13619 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CUL4AQ13619 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CUL4AQ13619 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CUL4AQ13619 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CUL4AQ13619 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CUL4AQ13619 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
CUL4AQ13619 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.58
CUL4AQ13619 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.58
CUL4AQ13619 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CUL4AQ13619 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CUL4AQ13619 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CUL4AQ13619 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CUL4AQ13619 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CUL4AQ13619 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CUL4AQ13619 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CUL4AQ13619 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CUL4AQ13619 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CUL4AQ13619 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CUL4AQ13619 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CUL4AQ13619 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CUL4AQ13619 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CUL4AQ13619 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CUL4AQ13619 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
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