Protein–RNA interactions for Protein: Q13541

EIF4EBP1, Eukaryotic translation initiation factor 4E-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4EBP1Q13541 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
EIF4EBP1Q13541 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
EIF4EBP1Q13541 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
EIF4EBP1Q13541 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
EIF4EBP1Q13541 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
EIF4EBP1Q13541 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
EIF4EBP1Q13541 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
EIF4EBP1Q13541 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
EIF4EBP1Q13541 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
EIF4EBP1Q13541 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
EIF4EBP1Q13541 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
EIF4EBP1Q13541 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
EIF4EBP1Q13541 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC12.96□□□□□ -0.33
EIF4EBP1Q13541 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
EIF4EBP1Q13541 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
EIF4EBP1Q13541 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
EIF4EBP1Q13541 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
EIF4EBP1Q13541 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
EIF4EBP1Q13541 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
EIF4EBP1Q13541 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
EIF4EBP1Q13541 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
EIF4EBP1Q13541 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
EIF4EBP1Q13541 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
EIF4EBP1Q13541 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
EIF4EBP1Q13541 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
EIF4EBP1Q13541 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
EIF4EBP1Q13541 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.34
EIF4EBP1Q13541 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
EIF4EBP1Q13541 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
EIF4EBP1Q13541 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
EIF4EBP1Q13541 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
EIF4EBP1Q13541 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
EIF4EBP1Q13541 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
EIF4EBP1Q13541 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
EIF4EBP1Q13541 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
EIF4EBP1Q13541 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
EIF4EBP1Q13541 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
EIF4EBP1Q13541 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
EIF4EBP1Q13541 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
EIF4EBP1Q13541 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
EIF4EBP1Q13541 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
EIF4EBP1Q13541 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
EIF4EBP1Q13541 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
EIF4EBP1Q13541 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
EIF4EBP1Q13541 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
EIF4EBP1Q13541 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
EIF4EBP1Q13541 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
EIF4EBP1Q13541 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
EIF4EBP1Q13541 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
EIF4EBP1Q13541 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
EIF4EBP1Q13541 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
EIF4EBP1Q13541 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
EIF4EBP1Q13541 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
EIF4EBP1Q13541 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
EIF4EBP1Q13541 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
EIF4EBP1Q13541 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC12.95□□□□□ -0.34
EIF4EBP1Q13541 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC12.95□□□□□ -0.34
EIF4EBP1Q13541 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
EIF4EBP1Q13541 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
EIF4EBP1Q13541 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
EIF4EBP1Q13541 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
EIF4EBP1Q13541 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
EIF4EBP1Q13541 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
EIF4EBP1Q13541 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
EIF4EBP1Q13541 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
EIF4EBP1Q13541 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
EIF4EBP1Q13541 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
EIF4EBP1Q13541 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
EIF4EBP1Q13541 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
EIF4EBP1Q13541 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
EIF4EBP1Q13541 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
EIF4EBP1Q13541 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
EIF4EBP1Q13541 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
EIF4EBP1Q13541 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
EIF4EBP1Q13541 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
EIF4EBP1Q13541 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
EIF4EBP1Q13541 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
EIF4EBP1Q13541 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
EIF4EBP1Q13541 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
EIF4EBP1Q13541 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
EIF4EBP1Q13541 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
EIF4EBP1Q13541 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
EIF4EBP1Q13541 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
EIF4EBP1Q13541 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
EIF4EBP1Q13541 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
EIF4EBP1Q13541 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
EIF4EBP1Q13541 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
EIF4EBP1Q13541 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
EIF4EBP1Q13541 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
EIF4EBP1Q13541 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
EIF4EBP1Q13541 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
EIF4EBP1Q13541 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
EIF4EBP1Q13541 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
EIF4EBP1Q13541 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
EIF4EBP1Q13541 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
EIF4EBP1Q13541 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
EIF4EBP1Q13541 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
EIF4EBP1Q13541 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
EIF4EBP1Q13541 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
EIF4EBP1Q13541 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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