Protein–RNA interactions for Protein: Q13536

C1orf61, Protein CROC-4, humanhuman

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Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf61Q13536 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C1orf61Q13536 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C1orf61Q13536 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C1orf61Q13536 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C1orf61Q13536 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C1orf61Q13536 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
C1orf61Q13536 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C1orf61Q13536 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C1orf61Q13536 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C1orf61Q13536 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C1orf61Q13536 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C1orf61Q13536 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C1orf61Q13536 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C1orf61Q13536 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C1orf61Q13536 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C1orf61Q13536 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C1orf61Q13536 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C1orf61Q13536 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C1orf61Q13536 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C1orf61Q13536 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C1orf61Q13536 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
C1orf61Q13536 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C1orf61Q13536 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C1orf61Q13536 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C1orf61Q13536 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C1orf61Q13536 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C1orf61Q13536 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C1orf61Q13536 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C1orf61Q13536 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C1orf61Q13536 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C1orf61Q13536 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C1orf61Q13536 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C1orf61Q13536 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C1orf61Q13536 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C1orf61Q13536 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
C1orf61Q13536 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C1orf61Q13536 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C1orf61Q13536 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C1orf61Q13536 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C1orf61Q13536 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C1orf61Q13536 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C1orf61Q13536 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
C1orf61Q13536 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C1orf61Q13536 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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C1orf61Q13536 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
C1orf61Q13536 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
C1orf61Q13536 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C1orf61Q13536 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C1orf61Q13536 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C1orf61Q13536 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C1orf61Q13536 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C1orf61Q13536 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C1orf61Q13536 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C1orf61Q13536 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C1orf61Q13536 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C1orf61Q13536 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C1orf61Q13536 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C1orf61Q13536 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C1orf61Q13536 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C1orf61Q13536 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C1orf61Q13536 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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C1orf61Q13536 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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C1orf61Q13536 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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C1orf61Q13536 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C1orf61Q13536 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
C1orf61Q13536 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C1orf61Q13536 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C1orf61Q13536 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C1orf61Q13536 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C1orf61Q13536 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
C1orf61Q13536 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C1orf61Q13536 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C1orf61Q13536 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C1orf61Q13536 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C1orf61Q13536 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
C1orf61Q13536 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C1orf61Q13536 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C1orf61Q13536 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
C1orf61Q13536 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C1orf61Q13536 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C1orf61Q13536 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C1orf61Q13536 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C1orf61Q13536 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C1orf61Q13536 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C1orf61Q13536 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C1orf61Q13536 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C1orf61Q13536 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C1orf61Q13536 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C1orf61Q13536 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C1orf61Q13536 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C1orf61Q13536 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C1orf61Q13536 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C1orf61Q13536 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C1orf61Q13536 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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