Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
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TUBB3Q13509 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TUBB3Q13509 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TUBB3Q13509 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TUBB3Q13509 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TUBB3Q13509 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TUBB3Q13509 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TUBB3Q13509 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TUBB3Q13509 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TUBB3Q13509 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TUBB3Q13509 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TUBB3Q13509 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TUBB3Q13509 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TUBB3Q13509 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
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TUBB3Q13509 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TUBB3Q13509 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TUBB3Q13509 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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TUBB3Q13509 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TUBB3Q13509 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TUBB3Q13509 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TUBB3Q13509 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TUBB3Q13509 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TUBB3Q13509 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TUBB3Q13509 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TUBB3Q13509 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TUBB3Q13509 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TUBB3Q13509 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
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TUBB3Q13509 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TUBB3Q13509 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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TUBB3Q13509 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TUBB3Q13509 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TUBB3Q13509 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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TUBB3Q13509 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TUBB3Q13509 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
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TUBB3Q13509 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
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TUBB3Q13509 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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TUBB3Q13509 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
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TUBB3Q13509 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
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TUBB3Q13509 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TUBB3Q13509 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TUBB3Q13509 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TUBB3Q13509 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
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TUBB3Q13509 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TUBB3Q13509 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TUBB3Q13509 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TUBB3Q13509 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TUBB3Q13509 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TUBB3Q13509 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TUBB3Q13509 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TUBB3Q13509 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TUBB3Q13509 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TUBB3Q13509 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TUBB3Q13509 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TUBB3Q13509 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TUBB3Q13509 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TUBB3Q13509 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1695.1 ms