Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TCIRG1Q13488 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TCIRG1Q13488 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TCIRG1Q13488 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TCIRG1Q13488 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TCIRG1Q13488 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
TCIRG1Q13488 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TCIRG1Q13488 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TCIRG1Q13488 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TCIRG1Q13488 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TCIRG1Q13488 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
TCIRG1Q13488 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TCIRG1Q13488 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TCIRG1Q13488 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TCIRG1Q13488 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TCIRG1Q13488 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
TCIRG1Q13488 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TCIRG1Q13488 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TCIRG1Q13488 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
TCIRG1Q13488 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TCIRG1Q13488 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TCIRG1Q13488 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
TCIRG1Q13488 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TCIRG1Q13488 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TCIRG1Q13488 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TCIRG1Q13488 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TCIRG1Q13488 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TCIRG1Q13488 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TCIRG1Q13488 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TCIRG1Q13488 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TCIRG1Q13488 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TCIRG1Q13488 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TCIRG1Q13488 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TCIRG1Q13488 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TCIRG1Q13488 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TCIRG1Q13488 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
TCIRG1Q13488 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TCIRG1Q13488 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TCIRG1Q13488 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TCIRG1Q13488 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TCIRG1Q13488 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TCIRG1Q13488 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TCIRG1Q13488 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TCIRG1Q13488 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TCIRG1Q13488 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TCIRG1Q13488 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TCIRG1Q13488 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TCIRG1Q13488 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TCIRG1Q13488 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TCIRG1Q13488 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TCIRG1Q13488 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TCIRG1Q13488 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
TCIRG1Q13488 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TCIRG1Q13488 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TCIRG1Q13488 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TCIRG1Q13488 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TCIRG1Q13488 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TCIRG1Q13488 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TCIRG1Q13488 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TCIRG1Q13488 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
TCIRG1Q13488 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TCIRG1Q13488 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TCIRG1Q13488 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TCIRG1Q13488 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TCIRG1Q13488 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TCIRG1Q13488 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TCIRG1Q13488 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TCIRG1Q13488 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TCIRG1Q13488 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TCIRG1Q13488 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
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TCIRG1Q13488 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TCIRG1Q13488 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TCIRG1Q13488 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TCIRG1Q13488 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TCIRG1Q13488 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TCIRG1Q13488 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TCIRG1Q13488 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TCIRG1Q13488 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
TCIRG1Q13488 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TCIRG1Q13488 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
TCIRG1Q13488 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TCIRG1Q13488 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
TCIRG1Q13488 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TCIRG1Q13488 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TCIRG1Q13488 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TCIRG1Q13488 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TCIRG1Q13488 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TCIRG1Q13488 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TCIRG1Q13488 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TCIRG1Q13488 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
TCIRG1Q13488 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TCIRG1Q13488 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TCIRG1Q13488 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TCIRG1Q13488 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TCIRG1Q13488 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TCIRG1Q13488 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
TCIRG1Q13488 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
TCIRG1Q13488 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TCIRG1Q13488 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
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