Protein–RNA interactions for Protein: Q13433

SLC39A6, Zinc transporter ZIP6, humanhuman

Predictions only

Length 755 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A6Q13433 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC39A6Q13433 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC39A6Q13433 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC39A6Q13433 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC39A6Q13433 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC39A6Q13433 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC39A6Q13433 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC39A6Q13433 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC39A6Q13433 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC39A6Q13433 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC39A6Q13433 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC39A6Q13433 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC39A6Q13433 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC39A6Q13433 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC39A6Q13433 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC39A6Q13433 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC39A6Q13433 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC39A6Q13433 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC39A6Q13433 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC39A6Q13433 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC39A6Q13433 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC39A6Q13433 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC39A6Q13433 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC39A6Q13433 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC39A6Q13433 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC39A6Q13433 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC39A6Q13433 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC39A6Q13433 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC39A6Q13433 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC39A6Q13433 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC39A6Q13433 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC39A6Q13433 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC39A6Q13433 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC39A6Q13433 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC39A6Q13433 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC39A6Q13433 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC39A6Q13433 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC39A6Q13433 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC39A6Q13433 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC39A6Q13433 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC39A6Q13433 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC39A6Q13433 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC39A6Q13433 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC39A6Q13433 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC39A6Q13433 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC39A6Q13433 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC39A6Q13433 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC39A6Q13433 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC39A6Q13433 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC39A6Q13433 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC39A6Q13433 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC39A6Q13433 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC39A6Q13433 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC39A6Q13433 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC39A6Q13433 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC39A6Q13433 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC39A6Q13433 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC39A6Q13433 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC39A6Q13433 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC39A6Q13433 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC39A6Q13433 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC39A6Q13433 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC39A6Q13433 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC39A6Q13433 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC39A6Q13433 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC39A6Q13433 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC39A6Q13433 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC39A6Q13433 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC39A6Q13433 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC39A6Q13433 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC39A6Q13433 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC39A6Q13433 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC39A6Q13433 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC39A6Q13433 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC39A6Q13433 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC39A6Q13433 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC39A6Q13433 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC39A6Q13433 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC39A6Q13433 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC39A6Q13433 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC39A6Q13433 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC39A6Q13433 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC39A6Q13433 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC39A6Q13433 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC39A6Q13433 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC39A6Q13433 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC39A6Q13433 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC39A6Q13433 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC39A6Q13433 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC39A6Q13433 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC39A6Q13433 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC39A6Q13433 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC39A6Q13433 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC39A6Q13433 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC39A6Q13433 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC39A6Q13433 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC39A6Q13433 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC39A6Q13433 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC39A6Q13433 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC39A6Q13433 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms