Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

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Length 1,112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDE3BQ13370 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDE3BQ13370 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDE3BQ13370 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDE3BQ13370 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDE3BQ13370 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDE3BQ13370 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDE3BQ13370 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDE3BQ13370 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDE3BQ13370 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PDE3BQ13370 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDE3BQ13370 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDE3BQ13370 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDE3BQ13370 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDE3BQ13370 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDE3BQ13370 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDE3BQ13370 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDE3BQ13370 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDE3BQ13370 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDE3BQ13370 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
PDE3BQ13370 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
PDE3BQ13370 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDE3BQ13370 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDE3BQ13370 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDE3BQ13370 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
PDE3BQ13370 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDE3BQ13370 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
PDE3BQ13370 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
PDE3BQ13370 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDE3BQ13370 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDE3BQ13370 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDE3BQ13370 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDE3BQ13370 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDE3BQ13370 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDE3BQ13370 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDE3BQ13370 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDE3BQ13370 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDE3BQ13370 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDE3BQ13370 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDE3BQ13370 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDE3BQ13370 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDE3BQ13370 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDE3BQ13370 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDE3BQ13370 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PDE3BQ13370 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDE3BQ13370 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDE3BQ13370 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDE3BQ13370 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDE3BQ13370 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDE3BQ13370 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDE3BQ13370 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDE3BQ13370 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDE3BQ13370 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDE3BQ13370 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDE3BQ13370 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDE3BQ13370 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PDE3BQ13370 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDE3BQ13370 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDE3BQ13370 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDE3BQ13370 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDE3BQ13370 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PDE3BQ13370 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDE3BQ13370 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDE3BQ13370 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDE3BQ13370 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDE3BQ13370 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDE3BQ13370 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDE3BQ13370 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDE3BQ13370 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDE3BQ13370 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDE3BQ13370 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDE3BQ13370 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDE3BQ13370 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDE3BQ13370 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDE3BQ13370 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDE3BQ13370 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDE3BQ13370 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDE3BQ13370 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDE3BQ13370 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDE3BQ13370 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDE3BQ13370 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDE3BQ13370 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDE3BQ13370 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDE3BQ13370 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDE3BQ13370 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDE3BQ13370 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDE3BQ13370 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDE3BQ13370 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDE3BQ13370 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDE3BQ13370 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDE3BQ13370 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDE3BQ13370 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDE3BQ13370 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
PDE3BQ13370 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDE3BQ13370 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
PDE3BQ13370 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDE3BQ13370 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDE3BQ13370 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDE3BQ13370 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
PDE3BQ13370 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
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