Protein–RNA interactions for Protein: Q13131

PRKAA1, 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAA1Q13131 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRKAA1Q13131 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRKAA1Q13131 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PRKAA1Q13131 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRKAA1Q13131 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRKAA1Q13131 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRKAA1Q13131 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRKAA1Q13131 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRKAA1Q13131 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRKAA1Q13131 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRKAA1Q13131 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRKAA1Q13131 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRKAA1Q13131 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRKAA1Q13131 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRKAA1Q13131 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRKAA1Q13131 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRKAA1Q13131 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRKAA1Q13131 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRKAA1Q13131 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRKAA1Q13131 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRKAA1Q13131 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRKAA1Q13131 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRKAA1Q13131 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRKAA1Q13131 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRKAA1Q13131 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRKAA1Q13131 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRKAA1Q13131 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRKAA1Q13131 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRKAA1Q13131 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRKAA1Q13131 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRKAA1Q13131 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRKAA1Q13131 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRKAA1Q13131 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRKAA1Q13131 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRKAA1Q13131 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRKAA1Q13131 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRKAA1Q13131 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRKAA1Q13131 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRKAA1Q13131 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRKAA1Q13131 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRKAA1Q13131 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRKAA1Q13131 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRKAA1Q13131 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRKAA1Q13131 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRKAA1Q13131 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRKAA1Q13131 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRKAA1Q13131 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRKAA1Q13131 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PRKAA1Q13131 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PRKAA1Q13131 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PRKAA1Q13131 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRKAA1Q13131 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRKAA1Q13131 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRKAA1Q13131 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRKAA1Q13131 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRKAA1Q13131 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRKAA1Q13131 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRKAA1Q13131 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRKAA1Q13131 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRKAA1Q13131 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRKAA1Q13131 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRKAA1Q13131 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRKAA1Q13131 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PRKAA1Q13131 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRKAA1Q13131 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRKAA1Q13131 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRKAA1Q13131 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRKAA1Q13131 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRKAA1Q13131 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRKAA1Q13131 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRKAA1Q13131 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRKAA1Q13131 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRKAA1Q13131 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRKAA1Q13131 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRKAA1Q13131 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRKAA1Q13131 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRKAA1Q13131 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRKAA1Q13131 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRKAA1Q13131 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRKAA1Q13131 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRKAA1Q13131 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRKAA1Q13131 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRKAA1Q13131 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRKAA1Q13131 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRKAA1Q13131 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRKAA1Q13131 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRKAA1Q13131 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRKAA1Q13131 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRKAA1Q13131 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRKAA1Q13131 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRKAA1Q13131 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRKAA1Q13131 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRKAA1Q13131 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRKAA1Q13131 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRKAA1Q13131 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRKAA1Q13131 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRKAA1Q13131 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRKAA1Q13131 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PRKAA1Q13131 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PRKAA1Q13131 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms