Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DUSP4Q13115 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DUSP4Q13115 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DUSP4Q13115 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DUSP4Q13115 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DUSP4Q13115 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DUSP4Q13115 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DUSP4Q13115 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DUSP4Q13115 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DUSP4Q13115 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DUSP4Q13115 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DUSP4Q13115 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DUSP4Q13115 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DUSP4Q13115 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DUSP4Q13115 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DUSP4Q13115 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DUSP4Q13115 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DUSP4Q13115 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DUSP4Q13115 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DUSP4Q13115 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DUSP4Q13115 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DUSP4Q13115 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DUSP4Q13115 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
DUSP4Q13115 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
DUSP4Q13115 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DUSP4Q13115 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DUSP4Q13115 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DUSP4Q13115 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DUSP4Q13115 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DUSP4Q13115 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DUSP4Q13115 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DUSP4Q13115 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
DUSP4Q13115 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
DUSP4Q13115 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
DUSP4Q13115 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
DUSP4Q13115 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
DUSP4Q13115 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
DUSP4Q13115 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
DUSP4Q13115 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
DUSP4Q13115 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
DUSP4Q13115 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DUSP4Q13115 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DUSP4Q13115 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DUSP4Q13115 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DUSP4Q13115 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DUSP4Q13115 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DUSP4Q13115 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DUSP4Q13115 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DUSP4Q13115 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DUSP4Q13115 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DUSP4Q13115 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DUSP4Q13115 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DUSP4Q13115 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DUSP4Q13115 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DUSP4Q13115 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DUSP4Q13115 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DUSP4Q13115 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DUSP4Q13115 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DUSP4Q13115 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
DUSP4Q13115 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
DUSP4Q13115 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
DUSP4Q13115 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DUSP4Q13115 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DUSP4Q13115 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DUSP4Q13115 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DUSP4Q13115 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DUSP4Q13115 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DUSP4Q13115 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DUSP4Q13115 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DUSP4Q13115 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DUSP4Q13115 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DUSP4Q13115 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DUSP4Q13115 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DUSP4Q13115 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DUSP4Q13115 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DUSP4Q13115 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DUSP4Q13115 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DUSP4Q13115 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DUSP4Q13115 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DUSP4Q13115 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DUSP4Q13115 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DUSP4Q13115 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DUSP4Q13115 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DUSP4Q13115 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DUSP4Q13115 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DUSP4Q13115 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DUSP4Q13115 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DUSP4Q13115 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
DUSP4Q13115 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DUSP4Q13115 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DUSP4Q13115 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DUSP4Q13115 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DUSP4Q13115 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DUSP4Q13115 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DUSP4Q13115 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
DUSP4Q13115 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DUSP4Q13115 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DUSP4Q13115 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DUSP4Q13115 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DUSP4Q13115 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
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