Protein–RNA interactions for Protein: Q13033

STRN3, Striatin-3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN3Q13033 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
STRN3Q13033 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
STRN3Q13033 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
STRN3Q13033 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
STRN3Q13033 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
STRN3Q13033 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
STRN3Q13033 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
STRN3Q13033 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
STRN3Q13033 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
STRN3Q13033 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
STRN3Q13033 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
STRN3Q13033 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
STRN3Q13033 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
STRN3Q13033 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
STRN3Q13033 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
STRN3Q13033 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
STRN3Q13033 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
STRN3Q13033 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
STRN3Q13033 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
STRN3Q13033 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
STRN3Q13033 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
STRN3Q13033 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
STRN3Q13033 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
STRN3Q13033 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
STRN3Q13033 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
STRN3Q13033 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
STRN3Q13033 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
STRN3Q13033 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
STRN3Q13033 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
STRN3Q13033 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
STRN3Q13033 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
STRN3Q13033 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
STRN3Q13033 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
STRN3Q13033 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
STRN3Q13033 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
STRN3Q13033 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
STRN3Q13033 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
STRN3Q13033 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
STRN3Q13033 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
STRN3Q13033 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
STRN3Q13033 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
STRN3Q13033 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
STRN3Q13033 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
STRN3Q13033 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
STRN3Q13033 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
STRN3Q13033 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
STRN3Q13033 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
STRN3Q13033 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
STRN3Q13033 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
STRN3Q13033 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
STRN3Q13033 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
STRN3Q13033 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
STRN3Q13033 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
STRN3Q13033 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
STRN3Q13033 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
STRN3Q13033 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
STRN3Q13033 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
STRN3Q13033 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
STRN3Q13033 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
STRN3Q13033 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
STRN3Q13033 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
STRN3Q13033 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
STRN3Q13033 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
STRN3Q13033 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
STRN3Q13033 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
STRN3Q13033 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
STRN3Q13033 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
STRN3Q13033 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
STRN3Q13033 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
STRN3Q13033 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
STRN3Q13033 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
STRN3Q13033 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
STRN3Q13033 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
STRN3Q13033 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
STRN3Q13033 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
STRN3Q13033 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
STRN3Q13033 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
STRN3Q13033 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
STRN3Q13033 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
STRN3Q13033 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
STRN3Q13033 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
STRN3Q13033 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
STRN3Q13033 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
STRN3Q13033 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
STRN3Q13033 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
STRN3Q13033 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
STRN3Q13033 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
STRN3Q13033 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
STRN3Q13033 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
STRN3Q13033 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
STRN3Q13033 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
STRN3Q13033 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
STRN3Q13033 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
STRN3Q13033 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
STRN3Q13033 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
STRN3Q13033 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
STRN3Q13033 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
STRN3Q13033 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
STRN3Q13033 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
STRN3Q13033 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
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