Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GRIK2Q13002 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GRIK2Q13002 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GRIK2Q13002 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GRIK2Q13002 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GRIK2Q13002 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GRIK2Q13002 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GRIK2Q13002 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GRIK2Q13002 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GRIK2Q13002 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GRIK2Q13002 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GRIK2Q13002 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GRIK2Q13002 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GRIK2Q13002 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GRIK2Q13002 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GRIK2Q13002 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GRIK2Q13002 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GRIK2Q13002 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GRIK2Q13002 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GRIK2Q13002 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GRIK2Q13002 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GRIK2Q13002 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GRIK2Q13002 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GRIK2Q13002 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GRIK2Q13002 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GRIK2Q13002 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GRIK2Q13002 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GRIK2Q13002 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GRIK2Q13002 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GRIK2Q13002 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GRIK2Q13002 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GRIK2Q13002 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GRIK2Q13002 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GRIK2Q13002 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GRIK2Q13002 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GRIK2Q13002 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GRIK2Q13002 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
GRIK2Q13002 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GRIK2Q13002 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GRIK2Q13002 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
GRIK2Q13002 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GRIK2Q13002 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
GRIK2Q13002 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GRIK2Q13002 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GRIK2Q13002 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GRIK2Q13002 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GRIK2Q13002 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
GRIK2Q13002 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GRIK2Q13002 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GRIK2Q13002 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GRIK2Q13002 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GRIK2Q13002 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GRIK2Q13002 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GRIK2Q13002 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GRIK2Q13002 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GRIK2Q13002 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GRIK2Q13002 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GRIK2Q13002 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GRIK2Q13002 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GRIK2Q13002 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GRIK2Q13002 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
GRIK2Q13002 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GRIK2Q13002 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GRIK2Q13002 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GRIK2Q13002 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GRIK2Q13002 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GRIK2Q13002 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GRIK2Q13002 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GRIK2Q13002 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GRIK2Q13002 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GRIK2Q13002 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GRIK2Q13002 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GRIK2Q13002 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GRIK2Q13002 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GRIK2Q13002 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GRIK2Q13002 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GRIK2Q13002 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GRIK2Q13002 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GRIK2Q13002 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GRIK2Q13002 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GRIK2Q13002 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GRIK2Q13002 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GRIK2Q13002 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GRIK2Q13002 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GRIK2Q13002 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
GRIK2Q13002 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GRIK2Q13002 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GRIK2Q13002 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GRIK2Q13002 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GRIK2Q13002 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
GRIK2Q13002 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GRIK2Q13002 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GRIK2Q13002 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
GRIK2Q13002 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GRIK2Q13002 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GRIK2Q13002 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GRIK2Q13002 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GRIK2Q13002 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GRIK2Q13002 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GRIK2Q13002 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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