Protein–RNA interactions for Protein: Q12846

STX4, Syntaxin-4, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX4Q12846 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
STX4Q12846 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
STX4Q12846 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
STX4Q12846 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
STX4Q12846 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
STX4Q12846 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
STX4Q12846 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
STX4Q12846 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
STX4Q12846 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
STX4Q12846 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
STX4Q12846 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
STX4Q12846 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
STX4Q12846 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
STX4Q12846 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
STX4Q12846 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
STX4Q12846 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
STX4Q12846 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
STX4Q12846 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
STX4Q12846 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
STX4Q12846 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
STX4Q12846 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
STX4Q12846 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
STX4Q12846 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
STX4Q12846 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
STX4Q12846 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
STX4Q12846 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
STX4Q12846 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
STX4Q12846 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
STX4Q12846 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
STX4Q12846 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
STX4Q12846 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
STX4Q12846 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
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STX4Q12846 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
STX4Q12846 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
STX4Q12846 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
STX4Q12846 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
STX4Q12846 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
STX4Q12846 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
STX4Q12846 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
STX4Q12846 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
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STX4Q12846 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
STX4Q12846 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
STX4Q12846 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
STX4Q12846 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
STX4Q12846 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
STX4Q12846 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
STX4Q12846 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
STX4Q12846 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
STX4Q12846 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
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STX4Q12846 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
STX4Q12846 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
STX4Q12846 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
STX4Q12846 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
STX4Q12846 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
STX4Q12846 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
STX4Q12846 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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STX4Q12846 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
STX4Q12846 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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STX4Q12846 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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STX4Q12846 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
STX4Q12846 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
STX4Q12846 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
STX4Q12846 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
STX4Q12846 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
STX4Q12846 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
STX4Q12846 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
STX4Q12846 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
STX4Q12846 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
STX4Q12846 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
STX4Q12846 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
STX4Q12846 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
STX4Q12846 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
STX4Q12846 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
STX4Q12846 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
STX4Q12846 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
STX4Q12846 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
STX4Q12846 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
STX4Q12846 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
STX4Q12846 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
STX4Q12846 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
STX4Q12846 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
STX4Q12846 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
STX4Q12846 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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