Protein–RNA interactions for Protein: Q12840

KIF5A, Kinesin heavy chain isoform 5A, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF5AQ12840 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
KIF5AQ12840 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
KIF5AQ12840 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
KIF5AQ12840 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
KIF5AQ12840 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
KIF5AQ12840 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
KIF5AQ12840 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
KIF5AQ12840 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
KIF5AQ12840 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
KIF5AQ12840 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
KIF5AQ12840 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
KIF5AQ12840 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
KIF5AQ12840 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
KIF5AQ12840 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
KIF5AQ12840 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
KIF5AQ12840 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
KIF5AQ12840 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
KIF5AQ12840 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
KIF5AQ12840 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
KIF5AQ12840 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KIF5AQ12840 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KIF5AQ12840 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KIF5AQ12840 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KIF5AQ12840 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KIF5AQ12840 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KIF5AQ12840 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KIF5AQ12840 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KIF5AQ12840 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KIF5AQ12840 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KIF5AQ12840 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KIF5AQ12840 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KIF5AQ12840 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KIF5AQ12840 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KIF5AQ12840 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KIF5AQ12840 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KIF5AQ12840 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KIF5AQ12840 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KIF5AQ12840 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KIF5AQ12840 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KIF5AQ12840 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KIF5AQ12840 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KIF5AQ12840 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KIF5AQ12840 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KIF5AQ12840 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
KIF5AQ12840 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
KIF5AQ12840 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KIF5AQ12840 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KIF5AQ12840 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KIF5AQ12840 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KIF5AQ12840 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KIF5AQ12840 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KIF5AQ12840 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KIF5AQ12840 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KIF5AQ12840 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KIF5AQ12840 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KIF5AQ12840 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KIF5AQ12840 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KIF5AQ12840 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KIF5AQ12840 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KIF5AQ12840 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KIF5AQ12840 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KIF5AQ12840 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KIF5AQ12840 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KIF5AQ12840 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KIF5AQ12840 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KIF5AQ12840 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KIF5AQ12840 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KIF5AQ12840 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KIF5AQ12840 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KIF5AQ12840 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KIF5AQ12840 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KIF5AQ12840 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
KIF5AQ12840 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
KIF5AQ12840 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KIF5AQ12840 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KIF5AQ12840 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KIF5AQ12840 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KIF5AQ12840 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KIF5AQ12840 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KIF5AQ12840 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KIF5AQ12840 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KIF5AQ12840 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KIF5AQ12840 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KIF5AQ12840 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KIF5AQ12840 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KIF5AQ12840 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KIF5AQ12840 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
KIF5AQ12840 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KIF5AQ12840 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KIF5AQ12840 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KIF5AQ12840 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KIF5AQ12840 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KIF5AQ12840 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KIF5AQ12840 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KIF5AQ12840 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KIF5AQ12840 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KIF5AQ12840 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KIF5AQ12840 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KIF5AQ12840 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KIF5AQ12840 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms