Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
FOXO1Q12778 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FOXO1Q12778 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
FOXO1Q12778 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
FOXO1Q12778 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FOXO1Q12778 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FOXO1Q12778 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FOXO1Q12778 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
FOXO1Q12778 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
FOXO1Q12778 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
FOXO1Q12778 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FOXO1Q12778 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
FOXO1Q12778 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FOXO1Q12778 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
FOXO1Q12778 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FOXO1Q12778 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
FOXO1Q12778 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FOXO1Q12778 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
FOXO1Q12778 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
FOXO1Q12778 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
FOXO1Q12778 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FOXO1Q12778 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
FOXO1Q12778 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FOXO1Q12778 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
FOXO1Q12778 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FOXO1Q12778 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FOXO1Q12778 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
FOXO1Q12778 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
FOXO1Q12778 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
FOXO1Q12778 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
FOXO1Q12778 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FOXO1Q12778 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
FOXO1Q12778 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
FOXO1Q12778 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
FOXO1Q12778 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FOXO1Q12778 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FOXO1Q12778 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FOXO1Q12778 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
FOXO1Q12778 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FOXO1Q12778 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FOXO1Q12778 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FOXO1Q12778 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FOXO1Q12778 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FOXO1Q12778 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FOXO1Q12778 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FOXO1Q12778 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FOXO1Q12778 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FOXO1Q12778 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FOXO1Q12778 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FOXO1Q12778 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FOXO1Q12778 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
FOXO1Q12778 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FOXO1Q12778 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FOXO1Q12778 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FOXO1Q12778 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
FOXO1Q12778 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
FOXO1Q12778 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FOXO1Q12778 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
FOXO1Q12778 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FOXO1Q12778 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
FOXO1Q12778 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FOXO1Q12778 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FOXO1Q12778 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FOXO1Q12778 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FOXO1Q12778 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
FOXO1Q12778 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FOXO1Q12778 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FOXO1Q12778 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
FOXO1Q12778 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
FOXO1Q12778 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FOXO1Q12778 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
FOXO1Q12778 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FOXO1Q12778 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FOXO1Q12778 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FOXO1Q12778 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FOXO1Q12778 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FOXO1Q12778 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FOXO1Q12778 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FOXO1Q12778 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FOXO1Q12778 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FOXO1Q12778 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FOXO1Q12778 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FOXO1Q12778 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FOXO1Q12778 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FOXO1Q12778 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FOXO1Q12778 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FOXO1Q12778 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FOXO1Q12778 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FOXO1Q12778 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXO1Q12778 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXO1Q12778 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXO1Q12778 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXO1Q12778 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXO1Q12778 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXO1Q12778 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXO1Q12778 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXO1Q12778 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXO1Q12778 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXO1Q12778 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXO1Q12778 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80 ms