Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RBBP4Q09028 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RBBP4Q09028 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RBBP4Q09028 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RBBP4Q09028 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RBBP4Q09028 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RBBP4Q09028 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RBBP4Q09028 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RBBP4Q09028 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RBBP4Q09028 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RBBP4Q09028 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RBBP4Q09028 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RBBP4Q09028 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RBBP4Q09028 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RBBP4Q09028 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RBBP4Q09028 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RBBP4Q09028 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RBBP4Q09028 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RBBP4Q09028 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RBBP4Q09028 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RBBP4Q09028 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RBBP4Q09028 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RBBP4Q09028 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RBBP4Q09028 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RBBP4Q09028 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RBBP4Q09028 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RBBP4Q09028 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RBBP4Q09028 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RBBP4Q09028 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RBBP4Q09028 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RBBP4Q09028 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RBBP4Q09028 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RBBP4Q09028 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RBBP4Q09028 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RBBP4Q09028 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
RBBP4Q09028 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RBBP4Q09028 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RBBP4Q09028 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RBBP4Q09028 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RBBP4Q09028 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RBBP4Q09028 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
RBBP4Q09028 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
RBBP4Q09028 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
RBBP4Q09028 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
RBBP4Q09028 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RBBP4Q09028 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RBBP4Q09028 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
RBBP4Q09028 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RBBP4Q09028 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RBBP4Q09028 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RBBP4Q09028 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RBBP4Q09028 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
RBBP4Q09028 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RBBP4Q09028 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RBBP4Q09028 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RBBP4Q09028 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RBBP4Q09028 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RBBP4Q09028 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RBBP4Q09028 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RBBP4Q09028 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RBBP4Q09028 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RBBP4Q09028 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RBBP4Q09028 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RBBP4Q09028 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RBBP4Q09028 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RBBP4Q09028 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
RBBP4Q09028 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RBBP4Q09028 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RBBP4Q09028 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RBBP4Q09028 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RBBP4Q09028 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RBBP4Q09028 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RBBP4Q09028 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RBBP4Q09028 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RBBP4Q09028 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RBBP4Q09028 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RBBP4Q09028 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RBBP4Q09028 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RBBP4Q09028 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RBBP4Q09028 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RBBP4Q09028 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RBBP4Q09028 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RBBP4Q09028 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RBBP4Q09028 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
RBBP4Q09028 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RBBP4Q09028 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RBBP4Q09028 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
RBBP4Q09028 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RBBP4Q09028 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
RBBP4Q09028 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RBBP4Q09028 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RBBP4Q09028 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
RBBP4Q09028 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RBBP4Q09028 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RBBP4Q09028 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
RBBP4Q09028 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
RBBP4Q09028 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RBBP4Q09028 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RBBP4Q09028 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RBBP4Q09028 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms