Protein–RNA interactions for Protein: Q08623

PUDP, Pseudouridine-5'-phosphatase, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUDPQ08623 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PUDPQ08623 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PUDPQ08623 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PUDPQ08623 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PUDPQ08623 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PUDPQ08623 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PUDPQ08623 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PUDPQ08623 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PUDPQ08623 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PUDPQ08623 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PUDPQ08623 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PUDPQ08623 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PUDPQ08623 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PUDPQ08623 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PUDPQ08623 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PUDPQ08623 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PUDPQ08623 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PUDPQ08623 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PUDPQ08623 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PUDPQ08623 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PUDPQ08623 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PUDPQ08623 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PUDPQ08623 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PUDPQ08623 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PUDPQ08623 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
PUDPQ08623 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PUDPQ08623 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PUDPQ08623 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PUDPQ08623 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PUDPQ08623 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PUDPQ08623 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PUDPQ08623 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PUDPQ08623 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PUDPQ08623 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PUDPQ08623 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PUDPQ08623 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PUDPQ08623 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PUDPQ08623 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PUDPQ08623 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PUDPQ08623 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
PUDPQ08623 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PUDPQ08623 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PUDPQ08623 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PUDPQ08623 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PUDPQ08623 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PUDPQ08623 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PUDPQ08623 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PUDPQ08623 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PUDPQ08623 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PUDPQ08623 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PUDPQ08623 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PUDPQ08623 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PUDPQ08623 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PUDPQ08623 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PUDPQ08623 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PUDPQ08623 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PUDPQ08623 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PUDPQ08623 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
PUDPQ08623 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PUDPQ08623 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PUDPQ08623 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PUDPQ08623 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PUDPQ08623 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PUDPQ08623 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PUDPQ08623 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PUDPQ08623 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PUDPQ08623 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PUDPQ08623 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
PUDPQ08623 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PUDPQ08623 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PUDPQ08623 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PUDPQ08623 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PUDPQ08623 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PUDPQ08623 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
PUDPQ08623 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PUDPQ08623 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PUDPQ08623 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PUDPQ08623 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PUDPQ08623 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
PUDPQ08623 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PUDPQ08623 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PUDPQ08623 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PUDPQ08623 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PUDPQ08623 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PUDPQ08623 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PUDPQ08623 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PUDPQ08623 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PUDPQ08623 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PUDPQ08623 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PUDPQ08623 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PUDPQ08623 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PUDPQ08623 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PUDPQ08623 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PUDPQ08623 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PUDPQ08623 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PUDPQ08623 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PUDPQ08623 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PUDPQ08623 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PUDPQ08623 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PUDPQ08623 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms