Protein–RNA interactions for Protein: Q05901

CHRNB3, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB3Q05901 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CHRNB3Q05901 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms