Protein–RNA interactions for Protein: Q04743

EMX2, Homeobox protein EMX2, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMX2Q04743 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EMX2Q04743 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EMX2Q04743 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EMX2Q04743 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EMX2Q04743 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EMX2Q04743 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EMX2Q04743 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EMX2Q04743 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EMX2Q04743 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EMX2Q04743 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EMX2Q04743 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EMX2Q04743 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EMX2Q04743 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EMX2Q04743 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EMX2Q04743 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EMX2Q04743 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EMX2Q04743 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EMX2Q04743 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EMX2Q04743 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EMX2Q04743 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EMX2Q04743 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EMX2Q04743 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EMX2Q04743 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EMX2Q04743 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EMX2Q04743 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EMX2Q04743 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EMX2Q04743 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
EMX2Q04743 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EMX2Q04743 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EMX2Q04743 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EMX2Q04743 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EMX2Q04743 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
EMX2Q04743 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EMX2Q04743 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EMX2Q04743 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EMX2Q04743 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EMX2Q04743 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EMX2Q04743 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EMX2Q04743 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EMX2Q04743 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EMX2Q04743 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EMX2Q04743 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EMX2Q04743 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EMX2Q04743 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EMX2Q04743 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
EMX2Q04743 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
EMX2Q04743 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
EMX2Q04743 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
EMX2Q04743 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EMX2Q04743 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EMX2Q04743 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
EMX2Q04743 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EMX2Q04743 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EMX2Q04743 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EMX2Q04743 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EMX2Q04743 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EMX2Q04743 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EMX2Q04743 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EMX2Q04743 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EMX2Q04743 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EMX2Q04743 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EMX2Q04743 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EMX2Q04743 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EMX2Q04743 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EMX2Q04743 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EMX2Q04743 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EMX2Q04743 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EMX2Q04743 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EMX2Q04743 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EMX2Q04743 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EMX2Q04743 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EMX2Q04743 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EMX2Q04743 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EMX2Q04743 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EMX2Q04743 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EMX2Q04743 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EMX2Q04743 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EMX2Q04743 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EMX2Q04743 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EMX2Q04743 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EMX2Q04743 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EMX2Q04743 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EMX2Q04743 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EMX2Q04743 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EMX2Q04743 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EMX2Q04743 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EMX2Q04743 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EMX2Q04743 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EMX2Q04743 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EMX2Q04743 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EMX2Q04743 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EMX2Q04743 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EMX2Q04743 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EMX2Q04743 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EMX2Q04743 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EMX2Q04743 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
EMX2Q04743 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EMX2Q04743 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EMX2Q04743 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EMX2Q04743 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms