Protein–RNA interactions for Protein: Q03188

CENPC, Centromere protein C, humanhuman

Predictions only

Length 943 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPCQ03188 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CENPCQ03188 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CENPCQ03188 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CENPCQ03188 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CENPCQ03188 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CENPCQ03188 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CENPCQ03188 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CENPCQ03188 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CENPCQ03188 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CENPCQ03188 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CENPCQ03188 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CENPCQ03188 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CENPCQ03188 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CENPCQ03188 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CENPCQ03188 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CENPCQ03188 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CENPCQ03188 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CENPCQ03188 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CENPCQ03188 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CENPCQ03188 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CENPCQ03188 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CENPCQ03188 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CENPCQ03188 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CENPCQ03188 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CENPCQ03188 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CENPCQ03188 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CENPCQ03188 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CENPCQ03188 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CENPCQ03188 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CENPCQ03188 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CENPCQ03188 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CENPCQ03188 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CENPCQ03188 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CENPCQ03188 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CENPCQ03188 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CENPCQ03188 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CENPCQ03188 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CENPCQ03188 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CENPCQ03188 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CENPCQ03188 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CENPCQ03188 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CENPCQ03188 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CENPCQ03188 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CENPCQ03188 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CENPCQ03188 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CENPCQ03188 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CENPCQ03188 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CENPCQ03188 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CENPCQ03188 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CENPCQ03188 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CENPCQ03188 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CENPCQ03188 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CENPCQ03188 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CENPCQ03188 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CENPCQ03188 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CENPCQ03188 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CENPCQ03188 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CENPCQ03188 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CENPCQ03188 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CENPCQ03188 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CENPCQ03188 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CENPCQ03188 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CENPCQ03188 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CENPCQ03188 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CENPCQ03188 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CENPCQ03188 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CENPCQ03188 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CENPCQ03188 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CENPCQ03188 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CENPCQ03188 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CENPCQ03188 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CENPCQ03188 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CENPCQ03188 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CENPCQ03188 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CENPCQ03188 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CENPCQ03188 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CENPCQ03188 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CENPCQ03188 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CENPCQ03188 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CENPCQ03188 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CENPCQ03188 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CENPCQ03188 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CENPCQ03188 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CENPCQ03188 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CENPCQ03188 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CENPCQ03188 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CENPCQ03188 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CENPCQ03188 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CENPCQ03188 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CENPCQ03188 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CENPCQ03188 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CENPCQ03188 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CENPCQ03188 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CENPCQ03188 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CENPCQ03188 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CENPCQ03188 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CENPCQ03188 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CENPCQ03188 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CENPCQ03188 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CENPCQ03188 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.6 ms