Protein–RNA interactions for Protein: Q02809

PLOD1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLOD1Q02809 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PLOD1Q02809 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PLOD1Q02809 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PLOD1Q02809 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PLOD1Q02809 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PLOD1Q02809 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PLOD1Q02809 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PLOD1Q02809 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PLOD1Q02809 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PLOD1Q02809 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PLOD1Q02809 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PLOD1Q02809 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PLOD1Q02809 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PLOD1Q02809 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PLOD1Q02809 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PLOD1Q02809 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PLOD1Q02809 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PLOD1Q02809 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PLOD1Q02809 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PLOD1Q02809 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PLOD1Q02809 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PLOD1Q02809 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PLOD1Q02809 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PLOD1Q02809 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PLOD1Q02809 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PLOD1Q02809 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PLOD1Q02809 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PLOD1Q02809 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PLOD1Q02809 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PLOD1Q02809 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PLOD1Q02809 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PLOD1Q02809 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PLOD1Q02809 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PLOD1Q02809 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PLOD1Q02809 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PLOD1Q02809 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PLOD1Q02809 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PLOD1Q02809 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PLOD1Q02809 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PLOD1Q02809 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PLOD1Q02809 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PLOD1Q02809 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PLOD1Q02809 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PLOD1Q02809 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PLOD1Q02809 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PLOD1Q02809 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PLOD1Q02809 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PLOD1Q02809 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PLOD1Q02809 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PLOD1Q02809 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PLOD1Q02809 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PLOD1Q02809 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PLOD1Q02809 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PLOD1Q02809 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PLOD1Q02809 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PLOD1Q02809 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PLOD1Q02809 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PLOD1Q02809 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PLOD1Q02809 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PLOD1Q02809 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PLOD1Q02809 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PLOD1Q02809 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PLOD1Q02809 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PLOD1Q02809 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PLOD1Q02809 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PLOD1Q02809 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PLOD1Q02809 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PLOD1Q02809 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PLOD1Q02809 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PLOD1Q02809 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PLOD1Q02809 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PLOD1Q02809 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PLOD1Q02809 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PLOD1Q02809 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PLOD1Q02809 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PLOD1Q02809 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PLOD1Q02809 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PLOD1Q02809 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PLOD1Q02809 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PLOD1Q02809 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PLOD1Q02809 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PLOD1Q02809 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PLOD1Q02809 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PLOD1Q02809 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PLOD1Q02809 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PLOD1Q02809 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PLOD1Q02809 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PLOD1Q02809 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PLOD1Q02809 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PLOD1Q02809 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PLOD1Q02809 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PLOD1Q02809 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PLOD1Q02809 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PLOD1Q02809 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PLOD1Q02809 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PLOD1Q02809 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PLOD1Q02809 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PLOD1Q02809 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PLOD1Q02809 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PLOD1Q02809 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms