Protein–RNA interactions for Protein: Q01118

SCN7A, Sodium channel protein type 7 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN7AQ01118 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SCN7AQ01118 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SCN7AQ01118 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SCN7AQ01118 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SCN7AQ01118 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SCN7AQ01118 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SCN7AQ01118 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SCN7AQ01118 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
SCN7AQ01118 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SCN7AQ01118 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SCN7AQ01118 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SCN7AQ01118 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SCN7AQ01118 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SCN7AQ01118 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SCN7AQ01118 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SCN7AQ01118 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SCN7AQ01118 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SCN7AQ01118 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SCN7AQ01118 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SCN7AQ01118 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SCN7AQ01118 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
SCN7AQ01118 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SCN7AQ01118 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SCN7AQ01118 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SCN7AQ01118 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SCN7AQ01118 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
SCN7AQ01118 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SCN7AQ01118 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SCN7AQ01118 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SCN7AQ01118 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SCN7AQ01118 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SCN7AQ01118 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SCN7AQ01118 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SCN7AQ01118 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SCN7AQ01118 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SCN7AQ01118 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SCN7AQ01118 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SCN7AQ01118 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SCN7AQ01118 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SCN7AQ01118 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SCN7AQ01118 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SCN7AQ01118 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SCN7AQ01118 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SCN7AQ01118 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SCN7AQ01118 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SCN7AQ01118 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SCN7AQ01118 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SCN7AQ01118 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SCN7AQ01118 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SCN7AQ01118 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SCN7AQ01118 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
SCN7AQ01118 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SCN7AQ01118 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SCN7AQ01118 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SCN7AQ01118 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
SCN7AQ01118 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SCN7AQ01118 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
SCN7AQ01118 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SCN7AQ01118 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SCN7AQ01118 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SCN7AQ01118 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SCN7AQ01118 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SCN7AQ01118 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SCN7AQ01118 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
SCN7AQ01118 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SCN7AQ01118 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SCN7AQ01118 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SCN7AQ01118 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SCN7AQ01118 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SCN7AQ01118 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SCN7AQ01118 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SCN7AQ01118 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SCN7AQ01118 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
SCN7AQ01118 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
SCN7AQ01118 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
SCN7AQ01118 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SCN7AQ01118 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SCN7AQ01118 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SCN7AQ01118 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SCN7AQ01118 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SCN7AQ01118 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SCN7AQ01118 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SCN7AQ01118 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SCN7AQ01118 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SCN7AQ01118 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SCN7AQ01118 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SCN7AQ01118 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SCN7AQ01118 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SCN7AQ01118 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SCN7AQ01118 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SCN7AQ01118 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SCN7AQ01118 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
SCN7AQ01118 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SCN7AQ01118 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SCN7AQ01118 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SCN7AQ01118 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SCN7AQ01118 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
SCN7AQ01118 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SCN7AQ01118 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SCN7AQ01118 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms