Protein–RNA interactions for Protein: P82094

TMF1, TATA element modulatory factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMF1P82094 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMF1P82094 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMF1P82094 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMF1P82094 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMF1P82094 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMF1P82094 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMF1P82094 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMF1P82094 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMF1P82094 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMF1P82094 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMF1P82094 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TMF1P82094 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMF1P82094 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMF1P82094 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMF1P82094 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMF1P82094 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMF1P82094 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMF1P82094 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TMF1P82094 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMF1P82094 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMF1P82094 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMF1P82094 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TMF1P82094 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMF1P82094 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMF1P82094 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMF1P82094 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMF1P82094 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMF1P82094 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMF1P82094 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMF1P82094 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMF1P82094 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMF1P82094 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMF1P82094 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMF1P82094 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMF1P82094 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMF1P82094 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMF1P82094 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMF1P82094 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TMF1P82094 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMF1P82094 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMF1P82094 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMF1P82094 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMF1P82094 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMF1P82094 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMF1P82094 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMF1P82094 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMF1P82094 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TMF1P82094 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TMF1P82094 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TMF1P82094 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMF1P82094 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMF1P82094 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TMF1P82094 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMF1P82094 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TMF1P82094 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TMF1P82094 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMF1P82094 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMF1P82094 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMF1P82094 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMF1P82094 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMF1P82094 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMF1P82094 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMF1P82094 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMF1P82094 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMF1P82094 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMF1P82094 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMF1P82094 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMF1P82094 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMF1P82094 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TMF1P82094 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMF1P82094 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMF1P82094 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMF1P82094 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TMF1P82094 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMF1P82094 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TMF1P82094 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMF1P82094 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMF1P82094 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMF1P82094 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMF1P82094 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMF1P82094 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMF1P82094 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMF1P82094 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMF1P82094 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMF1P82094 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMF1P82094 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMF1P82094 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMF1P82094 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TMF1P82094 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TMF1P82094 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMF1P82094 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMF1P82094 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMF1P82094 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMF1P82094 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMF1P82094 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMF1P82094 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMF1P82094 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMF1P82094 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMF1P82094 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMF1P82094 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms