Protein–RNA interactions for Protein: P81133

SIM1, Single-minded homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIM1P81133 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SIM1P81133 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SIM1P81133 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SIM1P81133 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SIM1P81133 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SIM1P81133 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SIM1P81133 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SIM1P81133 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SIM1P81133 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SIM1P81133 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SIM1P81133 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SIM1P81133 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SIM1P81133 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SIM1P81133 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SIM1P81133 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SIM1P81133 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SIM1P81133 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SIM1P81133 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SIM1P81133 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SIM1P81133 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SIM1P81133 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SIM1P81133 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SIM1P81133 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SIM1P81133 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SIM1P81133 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SIM1P81133 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SIM1P81133 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SIM1P81133 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SIM1P81133 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SIM1P81133 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SIM1P81133 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SIM1P81133 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SIM1P81133 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SIM1P81133 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SIM1P81133 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
SIM1P81133 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SIM1P81133 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SIM1P81133 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SIM1P81133 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SIM1P81133 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SIM1P81133 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SIM1P81133 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SIM1P81133 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SIM1P81133 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SIM1P81133 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SIM1P81133 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SIM1P81133 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
SIM1P81133 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SIM1P81133 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SIM1P81133 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SIM1P81133 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SIM1P81133 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SIM1P81133 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SIM1P81133 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SIM1P81133 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SIM1P81133 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SIM1P81133 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SIM1P81133 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SIM1P81133 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SIM1P81133 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SIM1P81133 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SIM1P81133 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SIM1P81133 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SIM1P81133 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SIM1P81133 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SIM1P81133 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SIM1P81133 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SIM1P81133 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SIM1P81133 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SIM1P81133 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SIM1P81133 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SIM1P81133 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SIM1P81133 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SIM1P81133 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SIM1P81133 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SIM1P81133 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SIM1P81133 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SIM1P81133 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SIM1P81133 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SIM1P81133 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SIM1P81133 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SIM1P81133 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SIM1P81133 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SIM1P81133 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SIM1P81133 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SIM1P81133 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SIM1P81133 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SIM1P81133 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SIM1P81133 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SIM1P81133 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SIM1P81133 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SIM1P81133 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SIM1P81133 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SIM1P81133 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SIM1P81133 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SIM1P81133 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SIM1P81133 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SIM1P81133 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SIM1P81133 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SIM1P81133 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms