Protein–RNA interactions for Protein: P78545

ELF3, ETS-related transcription factor Elf-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELF3P78545 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ELF3P78545 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ELF3P78545 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ELF3P78545 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ELF3P78545 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ELF3P78545 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ELF3P78545 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ELF3P78545 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ELF3P78545 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ELF3P78545 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ELF3P78545 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ELF3P78545 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ELF3P78545 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ELF3P78545 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ELF3P78545 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ELF3P78545 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ELF3P78545 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ELF3P78545 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ELF3P78545 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ELF3P78545 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ELF3P78545 KIAA0141-201ENST00000194118 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ELF3P78545 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ELF3P78545 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ELF3P78545 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ELF3P78545 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ELF3P78545 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ELF3P78545 WLS-201ENST00000262348 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ELF3P78545 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ELF3P78545 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ELF3P78545 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ELF3P78545 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ELF3P78545 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ELF3P78545 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ELF3P78545 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ELF3P78545 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ELF3P78545 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ELF3P78545 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ELF3P78545 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ELF3P78545 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ELF3P78545 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ELF3P78545 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ELF3P78545 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ELF3P78545 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ELF3P78545 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ELF3P78545 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ELF3P78545 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ELF3P78545 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ELF3P78545 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ELF3P78545 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ELF3P78545 MRVI1-204ENST00000527509 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ELF3P78545 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ELF3P78545 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ELF3P78545 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ELF3P78545 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ELF3P78545 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ELF3P78545 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ELF3P78545 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ELF3P78545 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ELF3P78545 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ELF3P78545 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ELF3P78545 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ELF3P78545 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ELF3P78545 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ELF3P78545 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ELF3P78545 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ELF3P78545 HBP1-212ENST00000485846 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ELF3P78545 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ELF3P78545 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ELF3P78545 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ELF3P78545 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ELF3P78545 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ELF3P78545 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ELF3P78545 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ELF3P78545 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ELF3P78545 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ELF3P78545 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ELF3P78545 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ELF3P78545 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ELF3P78545 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ELF3P78545 HEPACAM-201ENST00000298251 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ELF3P78545 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ELF3P78545 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ELF3P78545 TMPRSS6-201ENST00000346753 3197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ELF3P78545 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ELF3P78545 TMEM231-207ENST00000568377 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ELF3P78545 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ELF3P78545 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ELF3P78545 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ELF3P78545 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ELF3P78545 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ELF3P78545 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ELF3P78545 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ELF3P78545 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ELF3P78545 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ELF3P78545 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ELF3P78545 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ELF3P78545 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ELF3P78545 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ELF3P78545 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ELF3P78545 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms