Protein–RNA interactions for Protein: P60880

SNAP25, Synaptosomal-associated protein 25, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP25P60880 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNAP25P60880 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNAP25P60880 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNAP25P60880 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNAP25P60880 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNAP25P60880 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNAP25P60880 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNAP25P60880 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNAP25P60880 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNAP25P60880 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNAP25P60880 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNAP25P60880 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNAP25P60880 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNAP25P60880 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNAP25P60880 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNAP25P60880 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNAP25P60880 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SNAP25P60880 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SNAP25P60880 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNAP25P60880 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNAP25P60880 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNAP25P60880 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNAP25P60880 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SNAP25P60880 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNAP25P60880 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNAP25P60880 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNAP25P60880 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNAP25P60880 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNAP25P60880 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SNAP25P60880 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNAP25P60880 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SNAP25P60880 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SNAP25P60880 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNAP25P60880 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SNAP25P60880 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SNAP25P60880 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SNAP25P60880 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNAP25P60880 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNAP25P60880 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNAP25P60880 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNAP25P60880 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNAP25P60880 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNAP25P60880 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNAP25P60880 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNAP25P60880 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNAP25P60880 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNAP25P60880 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNAP25P60880 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
SNAP25P60880 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SNAP25P60880 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SNAP25P60880 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SNAP25P60880 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SNAP25P60880 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SNAP25P60880 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SNAP25P60880 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SNAP25P60880 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SNAP25P60880 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SNAP25P60880 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SNAP25P60880 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SNAP25P60880 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SNAP25P60880 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SNAP25P60880 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SNAP25P60880 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SNAP25P60880 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SNAP25P60880 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SNAP25P60880 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SNAP25P60880 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SNAP25P60880 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SNAP25P60880 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SNAP25P60880 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SNAP25P60880 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SNAP25P60880 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SNAP25P60880 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SNAP25P60880 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SNAP25P60880 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SNAP25P60880 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SNAP25P60880 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SNAP25P60880 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SNAP25P60880 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SNAP25P60880 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SNAP25P60880 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SNAP25P60880 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SNAP25P60880 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SNAP25P60880 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SNAP25P60880 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SNAP25P60880 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SNAP25P60880 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SNAP25P60880 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SNAP25P60880 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SNAP25P60880 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SNAP25P60880 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SNAP25P60880 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SNAP25P60880 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SNAP25P60880 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SNAP25P60880 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SNAP25P60880 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SNAP25P60880 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SNAP25P60880 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SNAP25P60880 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SNAP25P60880 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.6 ms