Protein–RNA interactions for Protein: P51587

BRCA2, Breast cancer type 2 susceptibility protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCA2P51587 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BRCA2P51587 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
BRCA2P51587 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BRCA2P51587 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
BRCA2P51587 SYCN-201ENST00000318438 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BRCA2P51587 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BRCA2P51587 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BRCA2P51587 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
BRCA2P51587 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
BRCA2P51587 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
BRCA2P51587 AC136475.1-202ENST00000602429 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BRCA2P51587 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
BRCA2P51587 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BRCA2P51587 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BRCA2P51587 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BRCA2P51587 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
BRCA2P51587 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
BRCA2P51587 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
BRCA2P51587 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BRCA2P51587 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BRCA2P51587 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
BRCA2P51587 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
BRCA2P51587 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BRCA2P51587 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
BRCA2P51587 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
BRCA2P51587 MEF2C-AS2-201ENST00000510274 463 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
BRCA2P51587 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BRCA2P51587 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
BRCA2P51587 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BRCA2P51587 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
BRCA2P51587 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
BRCA2P51587 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
BRCA2P51587 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BRCA2P51587 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
BRCA2P51587 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BRCA2P51587 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
BRCA2P51587 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
BRCA2P51587 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
BRCA2P51587 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BRCA2P51587 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
BRCA2P51587 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
BRCA2P51587 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
BRCA2P51587 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
BRCA2P51587 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
BRCA2P51587 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
BRCA2P51587 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
BRCA2P51587 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
BRCA2P51587 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
BRCA2P51587 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
BRCA2P51587 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
BRCA2P51587 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BRCA2P51587 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BRCA2P51587 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BRCA2P51587 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
BRCA2P51587 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BRCA2P51587 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
BRCA2P51587 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BRCA2P51587 AL845331.2-201ENST00000561882 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
BRCA2P51587 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
BRCA2P51587 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
BRCA2P51587 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
BRCA2P51587 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BRCA2P51587 NTF3-202ENST00000423158 1336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
BRCA2P51587 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
BRCA2P51587 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
BRCA2P51587 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
BRCA2P51587 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
BRCA2P51587 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
BRCA2P51587 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
BRCA2P51587 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
BRCA2P51587 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
BRCA2P51587 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
BRCA2P51587 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
BRCA2P51587 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
BRCA2P51587 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
BRCA2P51587 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
BRCA2P51587 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
BRCA2P51587 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
BRCA2P51587 AL096772.1-201ENST00000451135 781 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
BRCA2P51587 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
BRCA2P51587 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
BRCA2P51587 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
BRCA2P51587 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
BRCA2P51587 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
BRCA2P51587 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
BRCA2P51587 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
BRCA2P51587 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
BRCA2P51587 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
BRCA2P51587 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
BRCA2P51587 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
BRCA2P51587 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
BRCA2P51587 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
BRCA2P51587 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
BRCA2P51587 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
BRCA2P51587 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
BRCA2P51587 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
BRCA2P51587 NR0B2-201ENST00000254227 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
BRCA2P51587 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
BRCA2P51587 SERF2-206ENST00000409291 807 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
BRCA2P51587 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms