Protein–RNA interactions for Protein: P49247

RPIA, Ribose-5-phosphate isomerase, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPIAP49247 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPIAP49247 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPIAP49247 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPIAP49247 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPIAP49247 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPIAP49247 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPIAP49247 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPIAP49247 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPIAP49247 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPIAP49247 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPIAP49247 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPIAP49247 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPIAP49247 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPIAP49247 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RPIAP49247 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RPIAP49247 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RPIAP49247 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RPIAP49247 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RPIAP49247 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RPIAP49247 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RPIAP49247 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
RPIAP49247 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RPIAP49247 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RPIAP49247 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RPIAP49247 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RPIAP49247 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RPIAP49247 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RPIAP49247 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RPIAP49247 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RPIAP49247 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RPIAP49247 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RPIAP49247 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RPIAP49247 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RPIAP49247 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RPIAP49247 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
RPIAP49247 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RPIAP49247 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RPIAP49247 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
RPIAP49247 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RPIAP49247 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RPIAP49247 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RPIAP49247 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RPIAP49247 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RPIAP49247 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RPIAP49247 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RPIAP49247 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RPIAP49247 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RPIAP49247 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RPIAP49247 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RPIAP49247 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RPIAP49247 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RPIAP49247 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RPIAP49247 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RPIAP49247 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RPIAP49247 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RPIAP49247 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RPIAP49247 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPIAP49247 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPIAP49247 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPIAP49247 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPIAP49247 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPIAP49247 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPIAP49247 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPIAP49247 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPIAP49247 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPIAP49247 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPIAP49247 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPIAP49247 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RPIAP49247 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPIAP49247 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPIAP49247 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPIAP49247 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPIAP49247 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPIAP49247 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPIAP49247 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPIAP49247 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPIAP49247 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPIAP49247 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPIAP49247 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPIAP49247 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPIAP49247 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPIAP49247 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPIAP49247 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPIAP49247 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPIAP49247 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPIAP49247 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPIAP49247 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPIAP49247 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPIAP49247 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPIAP49247 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPIAP49247 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPIAP49247 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPIAP49247 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPIAP49247 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPIAP49247 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPIAP49247 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPIAP49247 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPIAP49247 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPIAP49247 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPIAP49247 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.5 ms