Protein–RNA interactions for Protein: P48506

GCLC, Glutamate--cysteine ligase catalytic subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 637 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLCP48506 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GCLCP48506 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GCLCP48506 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GCLCP48506 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GCLCP48506 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GCLCP48506 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GCLCP48506 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GCLCP48506 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GCLCP48506 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GCLCP48506 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GCLCP48506 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GCLCP48506 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GCLCP48506 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GCLCP48506 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GCLCP48506 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GCLCP48506 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GCLCP48506 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GCLCP48506 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GCLCP48506 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GCLCP48506 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
GCLCP48506 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GCLCP48506 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GCLCP48506 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GCLCP48506 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GCLCP48506 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GCLCP48506 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GCLCP48506 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GCLCP48506 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GCLCP48506 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GCLCP48506 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GCLCP48506 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GCLCP48506 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GCLCP48506 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GCLCP48506 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
GCLCP48506 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GCLCP48506 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GCLCP48506 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GCLCP48506 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GCLCP48506 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GCLCP48506 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GCLCP48506 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GCLCP48506 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GCLCP48506 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GCLCP48506 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GCLCP48506 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GCLCP48506 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GCLCP48506 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GCLCP48506 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GCLCP48506 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GCLCP48506 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GCLCP48506 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GCLCP48506 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GCLCP48506 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GCLCP48506 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GCLCP48506 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GCLCP48506 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GCLCP48506 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GCLCP48506 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GCLCP48506 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GCLCP48506 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GCLCP48506 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GCLCP48506 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GCLCP48506 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GCLCP48506 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GCLCP48506 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GCLCP48506 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
GCLCP48506 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GCLCP48506 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GCLCP48506 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
GCLCP48506 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GCLCP48506 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
GCLCP48506 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GCLCP48506 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GCLCP48506 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GCLCP48506 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GCLCP48506 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GCLCP48506 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
GCLCP48506 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GCLCP48506 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GCLCP48506 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GCLCP48506 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GCLCP48506 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GCLCP48506 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GCLCP48506 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GCLCP48506 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GCLCP48506 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GCLCP48506 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GCLCP48506 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GCLCP48506 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GCLCP48506 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GCLCP48506 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GCLCP48506 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GCLCP48506 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GCLCP48506 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GCLCP48506 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GCLCP48506 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GCLCP48506 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GCLCP48506 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GCLCP48506 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GCLCP48506 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.3 ms